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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000312`

染色体: Chr04 坐标: 2871097-2871636 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000312`
名称	SmilChr04G000312
描述	polygalacturonase inhibitor 1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	2871097 - 2871636 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021144`
GeneID	`131021144`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021144`
原始查询	`LOC131021144`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	polygalacturonase inhibitor 1-like
产物	polygalacturonase inhibitor 1-like
Arabidopsis	`AT5G06860` (PGIP1) polygalacturonase inhibiting protein 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830577] identity=55.4; qcov=1.01; evalue=3.73e-49; confidence=medium
Rice	`Os05g0104700` (PGIP4) - identity=50.7; qcov=0.939; evalue=4.19e-42; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021144

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057806217.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057806217.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806217.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806217.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806217.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:2871142`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B136,B94
`Chr4:2871196`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	49	A14,A15,A16,A22,A6,B1,B10,B100,B101,B102,B109,B113,B126,B133,B137,B16,B18,B24,B27,B31,B32,B33,B45,B47,B50,B56,B7,B72,B80,B83,B91,B96,B97,C18,C19,C20,C25,C29,C34,C40,C47,C5,C60,C63,C64,C66,C79,C8,D5
`Chr4:2871229`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,C53,C54,D8
`Chr4:2871280`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr4:2871348`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,A3,B68,C35,C46
`Chr4:2871354`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B53,C84,D3
`Chr4:2871360`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr4:2871435`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr4:2871512`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr4:2871516`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806217.1

147 aa

147

LRR_1

PF00560 LRR_1 11-26 aa PF00560 LRR_1 76-94 aa PF00560 LRR_1 100-118 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806217.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	11	26	1.5e-12	45.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057806217.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	76	94	1.5e-12	45.7	Leucine Rich Repeat
`XP_057806217.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	100	118	1.5e-12	45.7	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950234.1
TCCGCTGCGTTTTTCGACACGATCCCAACACTCTCTCACAACAAGCTGTCGGGCCCGCTTCCGTCTTCCTTGTCCAACGTAAACTTCTCGTCCGTGGATGTTTCTAGAAACAATCTGTCGGGGGATGCATCGGTGTTCTTCGGTGAAGGGAAGATCACGAGCAGCATCGACATCTCGAGGAACGGGTTCGAGTTTGATCTGTCGAAGGTGAGGTTCATGGAGGCGTTGGACGTGCTGGATATATCGCATAACAGGATCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021144
TCCGCTGCGTTTTTCGACACGATCCCAACACTCTCTCACAACAAGCTGTCGGGCCCGCTTCCGTCTTCCTTGTCCAACGTAAACTTCTCGTCCGTGGATGTTTCTAGAAACAATCTGTCGGGGGATGCATCGGTGTTCTTCGGTGAAGGGAAGATCACGAGCAGCATCGACATCTCGAGGAACGGGTTCGAGTTTGATCTGTCGAAGGTGAGGTTCATGGAGGCGTTGGACGTGCTGGATATATCGCATAACAGGATCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806217.1
SAAFFDTIPTLSHNKLSGPLPSSLSNVNFSSVDVSRNNLSGDASVFFGEGKITSSIDISRNGFEFDLSKVRFMEALDVLDISHNRIYGEIPQQITDAVFLQFLNVSYNRLCGKIPTGWKLRYRSEPWDNSSFLHNRCLCGIPLDPCK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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