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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000363`

染色体: Chr04 坐标: 3641399-3644058 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000363`
名称	SmilChr04G000363
描述	uncharacterized SmilChr04G000363
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	3641399 - 3644058 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021156`
GeneID	`131021156`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021156`
原始查询	`LOC131021156`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826611]; symbol=AT4G10200; hit=AT4G10200; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826611]; symbol=AT4G10200; hit=AT4G10200; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G10200` (AT4G10200) TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826611] identity=41.1; qcov=0.972; evalue=3.92e-179; confidence=medium
Rice	`Os02g0301400` - identity=25.9; qcov=0.453; evalue=4.91e-24; confidence=low
GO	GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF05699 (Dimer_Tnp_hAT); PF14291 (DUF4371); PF27073 (FAM200-ZBED5_RNase-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021156

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806230.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057806230.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806230.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806230.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806230.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:3641437`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C48
`Chr4:3641437`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C48
`Chr4:3641461`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr4:3641508`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,C22
`Chr4:3641517`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr4:3641528`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,C22
`Chr4:3641583`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B109
`Chr4:3641583`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B109
`Chr4:3641605`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C47
`Chr4:3641605`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C47
`Chr4:3641701`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B140
`Chr4:3641701`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B140

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806230.1

834 aa

417

834

DUF4371

FAM200-ZBED5_RNase-like

Dimer_Tnp_hAT

PF14291 DUF4371 190-427 aa PF27073 FAM200-ZBED5_RNase-like 309-432 aa PF05699 Dimer_Tnp_hAT 750-807 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806230.1`	Pfam	`PF14291`	DUF4371	Domain	190	427	3.3e-44	151.9	ZMYM1/FAM200, RNase-like domain
`XP_057806230.1`	Pfam	`PF27073`	FAM200-ZBED5_RNase-like	Domain	309	432	8.1e-15	55.6	FAM200/ZBED5 RNase-like
`XP_057806230.1`	Pfam	`PF05699`	Dimer_Tnp_hAT	Domain	750	807	4.3e-14	52.8	hAT family C-terminal dimerisation region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950247.1
TATGACTCGAAGTCTAAATCGGGATATGAAAAGCGCTGTAAAAAAAAGAAAGAAATTGAATTCATCGAATCTCAAAGGGGTGCTTTTCATAAGTTTTTGACAAAAAAACCTCAAGTAGGTGAAAAATCTGGTACTTCTAATGAGTTAGATGAAATTGTTGTTGATTGTGAGAATGCTGAAATTTTAAAAAATACTATTGATGATGTTAACAAGGATATTACAAATAATTCAAATGATCTGGATGATATTTCTGGTGGTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021156
TATGACTCGAAGTCTAAATCGGGATATGAAAAGCGCTGTAAAAAAAAGAAAGAAATTGAATTCATCGAATCTCAAAGGGGTGCTTTTCATAAGTTTTTGACAAAAAAACCTCAAGTAGGTGAAAAATCTGGTACTTCTAATGAGTTAGATGAAATTGTTGTTGATTGTGAGAATGCTGAAATTTTAAAAAATACTATTGATGATGTTAACAAGGATATTACAAATAATTCAAATGATCTGGATGATATTTCTGGTGGTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806230.1
YDSKSKSGYEKRCKKKKEIEFIESQRGAFHKFLTKKPQVGEKSGTSNELDEIVVDCENAEILKNTIDDVNKDITNNSNDLDDISGGENGNTNVTQNDSILVDIYDPRKWDGLDSNLIDVLVVNGPKRDLTIVNGPKDKYSRRFSSTFYTRYLSNGETCDREWLVYSKELDKVFCFCCKIFKKGHGKGQLTNEGFNDWTHLSTRLKEHETSVDHVLNMTTWCDLRYRLPQNETIDKVAQELLKKEKEYWKDVITRIIIIVK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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