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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000366`

染色体: Chr04 坐标: 3678262-3681252 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000366`
名称	SmilChr04G000366
描述	uncharacterized SmilChr04G000366
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	3678262 - 3681252 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021160`
GeneID	`131021160`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021160`
原始查询	`LOC131021160`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os02g0118800` - identity=30.2; qcov=0.517; evalue=6.86e-08; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021160

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057806233.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057806233.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057806233.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806233.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806233.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:3678272`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B133,B44
`Chr4:3678285`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	18	A18,B14,B140,B25,B29,B30,B35,B45,B49,B52,B85,B86,B93,B99,C19,C20,C41,C7
`Chr4:3678298`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,B90,C4
`Chr4:3678300`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B133,B44,C62,C69
`Chr4:3678315`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	13	A18,A22,B123,B22,B73,C1,C24,C30,C41,C57,C77,C87,D4
`Chr4:3680632`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr4:3680636`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr4:3680655`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B59,B81,C39,C75,C86
`Chr4:3680685`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,A6,C42
`Chr4:3680720`	`C`	`CAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	34	A1,A10,A16,A5,B10,B100,B101,B112,B120,B124,B2,B28,B29,B3,B48,B52,B57,B60,B61,B62,B66,B72,B76,B79,B81,B83,B87,B89,C14,C38,C42,C49,C59,D7
`Chr4:3680740`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B128,B71,C33,C62
`Chr4:3680775`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	39	A23,A24,A6,A7,B1,B111,B118,B122,B125,B127,B128,B16,B27,B31,B42,B43,B45,B55,B58,B60,B7,B71,B75,B91,B96,C11,C14,C17,C33,C36,C41,C42,C43,C62,C69,C84,C85,D3,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806233.1

230 aa

115

230

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 84-178 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806233.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	84	178	4e-16	60.2	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950250.1
ATGGTGGGACTTAAACCTCTTAAGTTTGTTTTCCCTAGACTTTACCATCTTTGTGCCAATAAAGATGCCCTCATCAGTGAATCGGGGGCTTGGGAGAACGGGAGATGGAAATGGCAGGTAACATGGCGTCGTGAGCTGCTTGAAAGAGAGGTGGAAGGGGTTAATGAACTCTTTAAGGTTATTGCTTTGGTTAATCCAGTTGTAGGTTCGCGTGACCGGTGGTCTTGGAGTGCTTCCAGCGACAGTATTTATTCAACACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021160
ATGGTGGGACTTAAACCTCTTAAGTTTGTTTTCCCTAGACTTTACCATCTTTGTGCCAATAAAGATGCCCTCATCAGTGAATCGGGGGCTTGGGAGAACGGGAGATGGAAATGGCAGGTAACATGGCGTCGTGAGCTGCTTGAAAGAGAGGTGGAAGGGGTTAATGAACTCTTTAAGGTTATTGCTTTGGTTAATCCAGTTGTAGGTTCGCGTGACCGGTGGTCTTGGAGTGCTTCCAGCGACAGTATTTATTCAACACG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806233.1
MVGLKPLKFVFPRLYHLCANKDALISESGAWENGRWKWQVTWRRELLEREVEGVNELFKVIALVNPVVGSRDRWSWSASSDSIYSTRSAYEAIKEAEHEMQREIDSKKILPKAWKIPAPHKAKVTAWRILQDRLPSCDNLRKRNILLSIEELHCNACFFQVESTNHLLLHCPKSVQVWDEIHKWLGVSFVRLQDVVSHFVAFTGLGNYCPDDRSPQRLRVPKIRPENPSL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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