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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000375`

染色体: Chr04 坐标: 3785608-3786108 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000375`
名称	SmilChr04G000375
描述	dirigent protein 22-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	3785608 - 3786108 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021163`
GeneID	`131021163`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021163`
原始查询	`LOC131021163`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dirigent protein 22-like
产物	dirigent protein 22-like
Arabidopsis	`AT4G38700` (AT4G38700) Disease resistance-responsive (dirigent-like protein) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830026] identity=36.1; qcov=0.934; evalue=2.59e-23; confidence=medium
Rice	`Os12g0174700` - identity=41; qcov=0.807; evalue=2.88e-27; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03018 (Dirigent)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021163

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057806236.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806236.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806236.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806236.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806236.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:3785718`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B1,B128,B71,B84,C33,C62,C71,C84
`Chr4:3785750`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr4:3785773`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr4:3785816`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,C85
`Chr4:3785827`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr4:3785838`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B114,B50
`Chr4:3785867`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr4:3785878`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:3785887`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr4:3785991`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B35,B58,C49
`Chr4:3786001`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B9,C54
`Chr4:3786018`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806236.1

166 aa

166

Dirigent

PF03018 Dirigent 26-163 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806236.1`	Pfam	`PF03018`	Dirigent	Family	26	163	7.5e-33	114.1	Dirigent-like protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950253.1
ATGTCCAAGTTTTGCATAGTTTTCCTACTGATGCTCACTATAGCTAGTGTCAAAAGCAAAAATTATAATAATATTACTAAATTTCGTGTTTATGTCCATGAATATTTTAGCGGGCCAAATGCAAATATTTATGAGGTTGCTCGAGCCAACATCACGGCTAATTCCCCGGCGTCCTTCGGCCTCGTCAGCGTCGGAGACACGTCGATGACGAGTGGGCCCGACATGAACACGGGGAAGTTGGGGCGGGCTCAAGGCTATAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021163
ATGTCCAAGTTTTGCATAGTTTTCCTACTGATGCTCACTATAGCTAGTGTCAAAAGCAAAAATTATAATAATATTACTAAATTTCGTGTTTATGTCCATGAATATTTTAGCGGGCCAAATGCAAATATTTATGAGGTTGCTCGAGCCAACATCACGGCTAATTCCCCGGCGTCCTTCGGCCTCGTCAGCGTCGGAGACACGTCGATGACGAGTGGGCCCGACATGAACACGGGGAAGTTGGGGCGGGCTCAAGGCTATAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806236.1
MSKFCIVFLLMLTIASVKSKNYNNITKFRVYVHEYFSGPNANIYEVARANITANSPASFGLVSVGDTSMTSGPDMNTGKLGRAQGYTVNTDLKELVTMLNAEFIFTVGKYRGSSLIVSGRINHELAIVGGTALFRMARGYVDSTTYFSDPHTGYVIGIFDFSVYLD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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