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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000383`

染色体: Chr04 坐标: 3906747-3907877 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000383`
名称	SmilChr04G000383
描述	uncharacterized SmilChr04G000383
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	3906747 - 3907877 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021166`
GeneID	`131021166`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021166`
原始查询	`LOC131021166`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013]; symbol=AT3G24255; hit=AT3G24255; species=arabidopsis; confidence=low
产物	RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013]; symbol=AT3G24255; hit=AT3G24255; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G24255` (AT3G24255) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013] identity=32.5; qcov=0.793; evalue=1.88e-34; confidence=low
Rice	`Os06g0484800` - identity=33.3; qcov=0.622; evalue=8.4e-32; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021166

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057806239.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057806239.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057806239.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806239.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806239.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:3906747`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B4,B63,C50,C54
`Chr4:3906750`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	A1,A24,B53,B72,B83,B94,C29,C42,C51,C59,C60,C62,C71,C73,C87,D1
`Chr4:3906771`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B81,C41
`Chr4:3906775`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B135,C11,C63,C69
`Chr4:3906780`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,B94
`Chr4:3906790`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C5
`Chr4:3906796`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	A8,B81,C41
`Chr4:3906796`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	CDS_variant	3	A8,B81,C41
`Chr4:3906798`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	A8,B81,C41
`Chr4:3906798`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	3	A8,B81,C41
`Chr4:3906813`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	A23,B111,B137,B58,B69,B79,B91,C60,C85,D4
`Chr4:3906828`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B81,C41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950256.1
ATGGACTTTCCAACGCACCTCTTATACGCGGACGATATCTTGGTCTTCTGCAAAGCTTCGGTTCGGAATGCTAAGAAGATTAAACATATTCTTGAGTACTATGGCAGATTGTCGGGGCAGGTGTGTAGTCTTGAAAAATCTCGCGTCTACTTTGCGAAAGGGGTTGCAACTCCGATGAAGAGAGGTATCAATCGTGTACTAGGGTTTACGCAGGGTAGCGATCATGTCACTTATTTAGGGGCCCCCCTCTTTGTGGGTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021166
ATGGACTTTCCAACGCACCTCTTATACGCGGACGATATCTTGGTCTTCTGCAAAGCTTCGGTTCGGAATGCTAAGAAGATTAAACATATTCTTGAGTACTATGGCAGATTGTCGGGGCAGGTGTGTAGTCTTGAAAAATCTCGCGTCTACTTTGCGAAAGGGGTTGCAACTCCGATGAAGAGAGGTATCAATCGTGTACTAGGGTTTACGCAGGGTAGCGATCATGTCACTTATTTAGGGGCCCCCCTCTTTGTGGGTCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806239.1
MDFPTHLLYADDILVFCKASVRNAKKIKHILEYYGRLSGQVCSLEKSRVYFAKGVATPMKRGINRVLGFTQGSDHVTYLGAPLFVGRPKAAQFMGIKDRIVQKFSRWAGLNLSMAGQLCLVKSVIQSSIVHTMMVFRWPKSLLHELDRKCRNFIWTGNTDQKPSCAVKWDRCCASLEEGGLGLRSFTLMNKSFLMKLAWNVIKGGDIASDVLRSRYLTPHGHARKNVANSSIWLGLKHEITDLVSSSYSAIGDGRSTLFW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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