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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G000049`

染色体: Chr04 坐标: 445765-452720 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G000049`
名称	SmilChr04G000049
描述	nuclear pore complex protein NUP62-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	445765 - 452720 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021172`
GeneID	`131021172`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021172`
原始查询	`LOC131021172`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclear pore complex protein NUP62-like
产物	nuclear pore complex protein NUP62-like
Arabidopsis	`AT2G45000` (EMB2766) structural constituent of nuclear pore [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819108] identity=67.4; qcov=0.344; evalue=2.79e-133; confidence=low
Rice	`Os01g0856600` - identity=57.9; qcov=0.122; evalue=5.71e-41; confidence=weak
GO	GO:0005543 (phospholipid binding); GO:0005643 (nuclear pore); GO:0006405 (RNA export from nucleus); GO:0006606 (protein import into nucleus); GO:0017056 (structural constituent of nuclear pore); GO:0044613 (nuclear pore central transport channel)
KEGG	smil03013 (Nucleocytoplasmic transport - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF05064 (Nsp1_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021172

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806246.1`
2	Nuclear pore complex	核孔复合体	1.00000	`XP_057806246.1`
3	Nucleus membrane	核膜	1.00000	`XP_057806246.1`
4	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057806246.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806246.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:446074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,B53,C78
`Chr4:446152`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B49
`Chr4:446152`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B49
`Chr4:446298`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,D4
`Chr4:446324`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr4:446385`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B40,C13,C28,C29
`Chr4:446415`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B37,B9
`Chr4:446515`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:446588`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B56
`Chr4:446610`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr4:446627`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B102,B39,B45
`Chr4:446627`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B102,B39,B45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806246.1

935 aa

468

935

Nsp1_C

PF05064 Nsp1_C 729-828 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806246.1`	Pfam	`PF05064`	Nsp1_C	Family	729	828	5.6e-22	78.4	Nsp1-like C-terminal region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950263.1
CCATCCCAAACCCTTCTCTCATTTTTCTTCACTCAAGCTGCCACAAACCGCTCACTGCTCTCTGTCGTCTCCAACTCGCACTGTTTATGTGTAAAATTGTTGTTGAAATCACATATGGAATTTTGAAATTGTTGTTGTTGAAATCACGTTTAGTTAGAATTTTGGAGAAAGGAACTGTCAAAATTTTCATATAATATTAGTACAGATTTCAAAACCCTCATTTCCCCCTCACGCAAAACCCATCTCCGCCAATCTGCGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021172
ATGGCTGGCACAGGATTCTCATTCGGCTTCTCCAATACTAGCTCCGCCTCCTCCGCACCTTCCTTCGGCATTGCCTCCGGAACCACACCGGCCTCCGCCGCCTCACCTTCTTTTGGCGTCGCTTCCGGAACCTCATCCACACCTTTATTTGGTTTTGGCTCCGCACCGACGTCCTCCTCCACATCGTCTTTTGGCTTTGCCTCCAACCCTAGCTCCGCAAATTCGTTTGGCTTTGGGTCGGGAACCGGCTCATCTCCGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806246.1
MAGTGFSFGFSNTSSASSAPSFGIASGTTPASAASPSFGVASGTSSTPLFGFGSAPTSSSTSSFGFASNPSSANSFGFGSGTGSSPFGASSLFGSSSSAAANIFGSTPGGAPTPGIFGSSSSGTGQTANAFGSAASNPAPTTPPPSSSPFGTQSAFGSPAPGSNLFGSGAPTPSLFGNSSSSAASASNTGSLFGSGTSATPNPFGSTTAGSGANATPNLFGSTTAGSGASATPNLFGSTTAGSGASATPNLFGSTTAGSG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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