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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002025`

染色体: Chr04 坐标: 32827842-32833088 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002025`
名称	SmilChr04G002025
描述	protease Do-like 9
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	32827842 - 32833088 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021195`
GeneID	`131021195`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021195`
原始查询	`LOC131021195`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protease Do-like 9
产物	protease Do-like 9
Arabidopsis	`AT5G40200` (DEG9) DegP protease 9 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834018] identity=84.5; qcov=0.811; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0234100` (OsDegp10) - identity=84.5; qcov=0.809; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00089 (Trypsin); PF13180 (PDZ_2); PF13365 (Trypsin_2); PF17815 (PDZ_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021195

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057806277.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057806277.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057806277.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806277.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806277.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:32828226`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B53,C8
`Chr4:32828268`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B94
`Chr4:32828414`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B88,D7
`Chr4:32828443`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B131,B41,B6,C22,C67
`Chr4:32829063`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:32829903`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B47,B58,B66,C82
`Chr4:32829919`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr4:32830610`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	A1,B65
`Chr4:32830610`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	CDS_variant	2	A1,B65
`Chr4:32830668`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr4:32830837`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr4:32830972`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B67,C55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806277.1

581 aa

290

581

Trypsin

Trypsin_2

PDZ_2

PDZ_3

PF00089 Trypsin 133-310 aa PF13365 Trypsin_2 148-285 aa PF13180 PDZ_2 326-426 aa PF17815 PDZ_3 433-578 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806277.1`	Pfam	`PF00089`	Trypsin	Domain	133	310	1e-19	72.0	Trypsin
`XP_057806277.1`	Pfam	`PF13365`	Trypsin_2	Domain	148	285	6e-22	79.7	Trypsin-like peptidase domain
`XP_057806277.1`	Pfam	`PF13180`	PDZ_2	Domain	326	426	7.5e-08	33.2	PDZ domain
`XP_057806277.1`	Pfam	`PF17815`	PDZ_3	Domain	433	578	1.5e-50	171.5	PDZ domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950294.1
TGGCCTAATGGTTAATTTCGATTCCCAATTCCATTTTGTTAGGCCCCAACTCGGATAGTTGTGTCTGTCGGTTTCGATCCGTGGTCAACGATTTTGGGTCCGGACTATTGACCCCCAAGCCAATTCGGGCCGGTTCAGCCGGTTCCAATTTGAACTGGGCGTCACTAATTCGATTTGTTTTGGTTTGGTTGTTTTGGTTCCGGTTTGCTCACCCATGGGAAAAACACTATAAAAACGGCGCCGTAGTATGAGTAGCAAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021195
ATGTGCAGCGAAACCAAACGCAAGCGGAAGCGCGGCGGCGGCCGCACAAAAATCCGATCGCCGGAGCTTGAGAACAGCAACAGCAACAATAACTCAGCTTCCCCGCCCACCACCAGCGCCGCAGAGAACGAGGTGGTCTTCTCCGTCAATAACGTGGAGCTCGTCAACACGAATGCTCCGTCCACCTCCGACCGTCACGGTCGCCGTCGCGGCCGTCCCCGTAAAGAACCCGAACCTGAACCACCCCTCCCCGCTGCCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806277.1
MCSETKRKRKRGGGRTKIRSPELENSNSNNNSASPPTTSAAENEVVFSVNNVELVNTNAPSTSDRHGRRRGRPRKEPEPEPPLPAASSKTLVLPIANGVVSTSLIKAENSVARAVPAMDAVVKVFCVHTEPNFSLPWQRKRQYSSSSSGFVIKGRRVLTNAHSVEHYTQVKLKKRGSDTKYVATVLAIGTECDIALLTVEDDEFWEGVSPVEFGDLPALQDAVTVVGYPIGGDTISVTSGVVSRIEILSYVHGSTELLGL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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