当前解析结果
SmilChr04G002033| 统一新 Gene ID | SmilChr04G002033 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G002033 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G002033 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 33022980 - 33027433 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131021204 |
|---|---|
| GeneID | 131021204 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131021204 |
| 原始查询 | LOC131021204 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131021204 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057806287.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 0.40000 | XP_057806287.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057806287.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057806287.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057806287.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:33026312 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 24 | A14,A22,A23,A7,B103,B106,B110,B123,B18,B28,B3,B40,B43,B45,B46,B76,C15,C20,C41,C51,C83,D3,D5,D9 |
Chr4:33026383 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B29,C79 |
Chr4:33026388 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B15 |
Chr4:33026389 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B112 |
Chr4:33026391 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C79 |
Chr4:33026404 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B12,B68,D2 |
Chr4:33026405 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B82,C64,C66,D7 |
Chr4:33026407 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C40 |
Chr4:33026411 |
C |
CG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 10 | B110,B112,B121,B3,B45,B55,B90,B92,C22,D1 |
Chr4:33026413 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B15,C23 |
Chr4:33026421 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B112,B93 |
Chr4:33026435 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B100,B104,B140,B37,D7 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。