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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002036`

染色体: Chr04 坐标: 33057674-33061813 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002036`
名称	SmilChr04G002036
描述	calmodulin-binding protein 60 A-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	33057674 - 33061813 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021205`
GeneID	`131021205`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021205`
原始查询	`LOC131021205`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	calmodulin-binding protein 60 A-like
产物	calmodulin-binding protein 60 A-like
Arabidopsis	`AT5G62570` (AT5G62570) Calmodulin binding protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836377] identity=32; qcov=0.577; evalue=2.46e-43; confidence=low
Rice	`Os04g0444200` (OsCaM) - identity=30.3; qcov=0.682; evalue=5.64e-38; confidence=low
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005516 (calmodulin binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding); GO:0080142 (regulation of salicylic acid biosynthetic process)
KEGG	-
Pfam	PF07887 (Calmodulin_bind); PF20451 (Calmod_bind_M); PF20452 (Calmod_bind_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021205

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806288.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806288.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806288.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806288.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057806288.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:33058126`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B44,B59,B86
`Chr4:33058141`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B90,B92,C87,C9
`Chr4:33058146`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr4:33058252`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B47,B58,B66,C82
`Chr4:33058644`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B103,B91
`Chr4:33058666`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr4:33058718`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr4:33058742`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr4:33058774`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr4:33058839`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B103,B91
`Chr4:33058954`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr4:33059000`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B136,B66,C10,C55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806288.1

591 aa

296

591

Calmodulin_bind

Calmod_bind_M

Calmod_bind_C

PF07887 Calmodulin_bind 91-231 aa PF20451 Calmod_bind_M 244-308 aa PF20452 Calmod_bind_C 314-365 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806288.1`	Pfam	`PF07887`	Calmodulin_bind	Domain	91	231	2.8e-21	76.9	Calmodulin binding protein-like N-terminal domain
`XP_057806288.1`	Pfam	`PF20451`	Calmod_bind_M	Domain	244	308	1.3e-21	77.6	Calmodulin binding protein central domain
`XP_057806288.1`	Pfam	`PF20452`	Calmod_bind_C	Domain	314	365	1.2e-05	26.1	Calmodulin binding protein C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950305.1
TTTAAATTTATTATGAGTTGGATAAGTGCATCATATAACCAAAAGGGCGTCTACTTTTACAAAAACAGACTCACAAATGGCAAAATCTAGTACGCCTCCACAGGTATAATGTAGTGTAGTAGAGTGTGTGTTGGTGGATTTGTACACTCCACTCGGTTTTTGGGCCCCCTAATCATCATTTCCGACAATATAAATACTACTCAGTTCGGAAAGAATCATTATATTTTATCGTTGGAACATTCTTCACTAAATTTGTGTAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021205
ATGGAGCATGATGAAATTAATGGTGCTTCATCAGATCCTGGCCAAGCTCTTGCTCTAACTATACGAAAGATAATGGAAAAGGAATTGGAACCTTTGGTGTTAAAAATGGTTAGTGCAGTGATAAAGCCGATGGTCATCACTACCGTCCAACAAGAGATAGTACCACTTGCTGAGGATCTAATCCGTAGAGTGGTCAAAGAGGTTTTTCAACCTGTTGAAGAGAAGCTTTTGAATGGAGGGAGTCGGGATGAGTTGCCAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806288.1
MEHDEINGASSDPGQALALTIRKIMEKELEPLVLKMVSAVIKPMVITTVQQEIVPLAEDLIRRVVKEVFQPVEEKLLNGGSRDELPKGGSLQLKFLDDVSDTVTGEELKGIKYECLKLALLNPDGNIVASGRESSAKVEILLLHDNGNDDITIENFERSIIQTGEKKKPHFAKSVYISLKEGVGDLNGLKLGHDKDWIKLCNCRLGARIGQNLEGTTVQEAWTLPFKVTDKRDKQYDKHPLPFLSSEVWRLEGVCRNGKR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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