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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002048`

染色体: Chr04 坐标: 33213176-33215473 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002048`
名称	SmilChr04G002048
描述	U-box domain-containing protein 38-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	33213176 - 33215473 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021217`
GeneID	`131021217`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021217`
原始查询	`LOC131021217`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	U-box domain-containing protein 38-like
产物	U-box domain-containing protein 38-like
Arabidopsis	`AT5G65200` (PUB38) plant U-box 38 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836643] identity=52.4; qcov=0.985; evalue=7.86e-165; confidence=high
Rice	`Os06g0238000` (OsPUB20) - identity=44; qcov=0.55; evalue=5.96e-63; confidence=medium
GO	GO:0004842 (ubiquitin-protein transferase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0016567 (protein ubiquitination)
KEGG	-
Pfam	PF00514 (Arm); PF04564 (U-box)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021217

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057806303.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057806303.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057806303.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806303.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806303.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:33213655`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B140,B59,B86,B88
`Chr4:33213710`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr4:33213844`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,C37,D11
`Chr4:33213943`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr4:33214403`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr4:33214604`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54
`Chr4:33214822`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A25,B2,C19,C84
`Chr4:33214944`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B6,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806303.1

529 aa

264

529

U-box

Arm

PF04564 U-box 26-94 aa PF00514 Arm 287-324 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806303.1`	Pfam	`PF04564`	U-box	Domain	26	94	2.2e-10	41.3	U-box domain
`XP_057806303.1`	Pfam	`PF00514`	Arm	Repeat	287	324	1.3e-21	76.6	Armadillo/beta-catenin-like repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950320.1
TGAATTAAAAATTGAATAAAACCTAGAGCAGCTGGATTTAAGCATAGTCCGAGCAAAGAAGTTGTTCAATGATAGTATTTCATTTTATATTTCCCTTTGAAGAAAGATGATGACTCATTCTTCAAACAGTCTTCCATAAGTATAACATAATTAACAGTATCATAATTAGCGCACATCGTGAAACGGCATTTCCTCTCTTCTCTCATCATCTCCATCAACAACAACAACATCACCATTTTCTCTCTCATCCGCACGCACGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021217
ATGGGCGGAAATGGCAAGTTCCGCCGCTGGAGAATCTCGTTCCACAGATCTCCGGCCACCGCCAACAAGGACCCGCCGCAGGAATTCCTCTGCCCAATCTCCAACTCCTTGATGTTTGACCCCGCCATCGTCTCCTCCGGCCAGACATTCGAGCGCGCGTGCGTCGACGTCTGCACAGCTCTGAGCTTCGCCCCCACTCTCGCCGACGGCTCCAAGCCCGATTTCTCAACGGTCATCCCCAATTTAGCTCTCAAAACTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806303.1
MGGNGKFRRWRISFHRSPATANKDPPQEFLCPISNSLMFDPAIVSSGQTFERACVDVCTALSFAPTLADGSKPDFSTVIPNLALKTAILSWCSKTGSGRPSPPVHSEIESTIRSLSASTGTLESPKILVSEKELLKGVAETPPILFSHAATELNSRDLNLSSSSEESVIANATPLLPFATRPSCFSYSSSPSTSSEFVAEEGSTNAASINSSSEDENFITKMRSLDVYEQEQAVIQLRKTTRTSEEARATLCSERLLLAL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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