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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002077`

染色体: Chr04 坐标: 33516854-33519788 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002077`
名称	SmilChr04G002077
描述	TORTIFOLIA1-like protein 5
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	33516854 - 33519788 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021244`
GeneID	`131021244`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021244`
原始查询	`LOC131021244`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TORTIFOLIA1-like protein 5
产物	TORTIFOLIA1-like protein 5
Arabidopsis	`AT1G27210` (AT1G27210) ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839610] identity=42.3; qcov=0.917; evalue=5.41e-123; confidence=medium
Rice	`Os02g0739900` - identity=38.1; qcov=1.03; evalue=3.16e-75; confidence=medium
GO	GO:0005874 (microtubule); GO:0008017 (microtubule binding)
KEGG	-
Pfam	PF13513 (HEAT_EZ); PF24714 (TOR1L1_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021244

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806339.1`
2	Cytoskeleton	细胞骨架	0.40000	`XP_057806339.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057806339.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806339.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806339.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:33517221`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B49,B79,C85
`Chr4:33517221`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B49,B79,C85
`Chr4:33517246`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	14	B103,B106,B107,B109,B119,B121,B134,B29,B34,B40,C12,C15,C51,D1
`Chr4:33517261`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C39,C75
`Chr4:33517295`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:33517316`	`C`	`CAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B115,B78
`Chr4:33517316`	`C`	`CAG`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B115,B78
`Chr4:33517376`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	A9,B111,B12,B4,B55,B60,B98,C5,C72,C73,D2,D8
`Chr4:33517509`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54
`Chr4:33517753`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr4:33517825`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:33517828`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806339.1

588 aa

294

588

TOR1L1_N

HEAT_EZ

PF24714 TOR1L1_N 12-286 aa PF13513 HEAT_EZ 66-115 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806339.1`	Pfam	`PF24714`	TOR1L1_N	Repeat	12	286	1.7e-108	362.9	TORTIFOLIA1 N-terminal
`XP_057806339.1`	Pfam	`PF13513`	HEAT_EZ	Repeat	66	115	5.6e-08	33.8	HEAT-like repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950356.1
AAAGCATATGCAATTGGCGGGGCCTAAATCTAATACGACAACGTACCGTTACCCTTTATCAATCTTCCTAATCCCATCCCACTATATATTCATAAATCCCCAAAACCAAACACACCACAACTCGGATAAAAACTCCCCCAAAATCCAACCACCGTCACCGTGATGCTGCCGCCGGCGCTCACATTTCCATCCTAAACTCTCTCCTGCAACGCCAATTAAACAATGCCGGCCTCCAGCAAGCAGGCGCAGGCACGTGACTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021244
ATGCCGGCCTCCAGCAAGCAGGCGCAGGCACGTGACTTCAAACACCGCGTGCTCACGTGCCTCCACAAGCTCTCCGACAGGGACACCCACGCCGCCGCCGCGTCGGAGCTCGAGTCCATCGCCCGCACTCTCCCCGTCGATGCCCTCCCTTCCTTCATCTCCTCCATCTCCGCCACCGACTCCTCCGACAGGTCCCCGGTCCGCCGCCACTGCATCCGCCTCGTTGCCGTCCTCGCCGCCGCCCACGGCGACGCCCTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806339.1
MPASSKQAQARDFKHRVLTCLHKLSDRDTHAAAASELESIARTLPVDALPSFISSISATDSSDRSPVRRHCIRLVAVLAAAHGDALSPHLSRILSAVARRLRDPDSSVRAACVAAALSLASHLASAPFTTVAKPFLESLFAEQEASAQNGAALCLAAVIEGSTNPDVGGLRKLLPRLEKLAKCESFKAKAAILALVGSLVAVEGVLSGGGRNAVRNLIACLTELLSSEDWAARKAAAEALMKMALVERDALSEYKASCLK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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