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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002081`

染色体: Chr04 坐标: 33579108-33581076 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002081`
名称	SmilChr04G002081
描述	uncharacterized SmilChr04G002081
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	33579108 - 33581076 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021254`
GeneID	`131021254`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021254`
原始查询	`LOC131021254`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823962]; symbol=AT3G48070; hit=AT3G48070; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823962]; symbol=AT3G48070; hit=AT3G48070; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G48070` (AT3G48070) RING/U-box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823962] identity=43.3; qcov=1; evalue=4.92e-61; confidence=medium
Rice	`Os04g0463700` - identity=36.5; qcov=0.97; evalue=2.59e-45; confidence=medium
GO	GO:0004842 (ubiquitin-protein transferase activity); GO:0016567 (protein ubiquitination); GO:0030014 (CCR4-NOT complex)
KEGG	-
Pfam	PF14570 (zf-RING_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021254

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806348.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806348.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806348.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806348.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057806348.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:33580364`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:33580472`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:33580477`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B38,B39,B85,C13
`Chr4:33580565`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,B78
`Chr4:33580722`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B138,B31,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806348.1

364 aa

182

364

zf-RING_4

PF14570 zf-RING_4 289-335 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806348.1`	Pfam	`PF14570`	zf-RING_4	Domain	289	335	1.8e-17	63.5	RING/Ubox like zinc-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950365.1
TCTCATTTCACGGCGACTGCTCACGGTGATCTTTGCGTGCCACGCGCGAGACGTAAGGGCAGAACAGTAATTGCGAGGACTATATATAGGCAGCCAGTTGTTATGCTCACGCCTTTTGTTCGTACAGTCGGAAAAAGAGAAGTGCAAAAAAGGGCTAATTGAGTTTCTGTTTATCTATCTCTCTTCTCTCTCTATCTTTCATTTTCTCTCTCCGCGCCCGTTTCCGATCAATTTAGGGTTTTTCCGATTCCTGCCTCACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021254
ATGATTTCTGATTCGATCCCCAACGCATCTGTCGCCCATGCCTCATCTAACCCCAAAGATTTTGCTAAGAAGAAAAGGGCCAACCGGTCGGCGAAGTTAAAGCAGTGCAAGCTTGATGCTCGTCGGGAACAGTGGCTTTCTCAAGTGAAGAGTAAGGGTGGGTGTAAGGAGGGGGTGAATGGTGAAGGGGGTGCACGTGGAGGTCTGATGGACTTGGGAAACAAGAACATGCCTATAGAGAAGCTGGAGATAAGTTCGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806348.1
MISDSIPNASVAHASSNPKDFAKKKRANRSAKLKQCKLDARREQWLSQVKSKGGCKEGVNGEGGARGGLMDLGNKNMPIEKLEISSRCEDGMYIDGLSVHHFSDFESSPSNSPTSSILGSNDSGVNFTSSSRSSSRSGRSSSCSTNGCFSGIMSEEDEGNVGDDGCLDDWEAMADALAATEDKQPGRNPSSGYGLPVEKHGNTVVCSSEMSLAKQRENDIPSEKQESGGTSVQISQAKCQAWRPDDTFRPQSLPNLSKQF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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