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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002093`

染色体: Chr04 坐标: 33751699-33753691 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002093`
名称	SmilChr04G002093
描述	transcription factor MYB35-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	33751699 - 33753691 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021257`
GeneID	`131021257`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021257`
原始查询	`LOC131021257`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor MYB35-like
产物	transcription factor MYB35-like
Arabidopsis	`AT1G18960` (AT1G18960) myb-like HTH transcriptional regulator family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838477] identity=32.9; qcov=1.23; evalue=3.42e-43; confidence=low
Rice	`Os03g0296000` (OsTDF1) - identity=33.3; qcov=1.11; evalue=5.14e-39; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding); PF13921 (Myb_DNA-bind_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021257

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806351.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806351.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806351.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806351.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057806351.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:33751894`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B57,B88,C27,C55
`Chr4:33751902`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,C37,C49,C82
`Chr4:33751918`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr4:33752061`	`AG`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	3	C55,D4,D9
`Chr4:33752083`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr4:33752086`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B88,D11
`Chr4:33752107`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr4:33752271`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B41,B47,B58,B66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806351.1

256 aa

128

256

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

PF00249 Myb_DNA-binding 69-110 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 70-117 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806351.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	69	110	2.7e-13	50.5	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057806351.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	70	117	2.1e-11	44.5	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950368.1
GTTTCGAGTGCTCTTTGCACCATTAAAACAAACACAAAAACGCATGTTATCTCAGAAATTCATTTATTAATTCTCTCTTCAATTTTCTATTCCCAAAAAACAAAAATATGAATACAAGTCATGCAAATACACCTCACCCCATGCTTTTCTCGCCTCTTTCTCTGCTCCTTATTTATTAAAGGCCTCTTAAAATTTTATCATAATTCTCACCGCGATATTCATTAATTCCTCCAAAATCATATACTAATTCTCCACAAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021257
ATGGTAAAAACCAGCAGCTCCGAATTGCATAAGGCTGCTTGGAACGAAGATGGAGATGCAAAAATGGCTGCTGCGTTTGCTTCCAAGCAGCGAGGAACAGGTAACTGGACAACTTCTTCCAAGAGATCAGGGCAGAGAAGAAGTGGGAAAAACTGTAGAGAGAGATGGGGCAATAATCAGAAGCCTGCAGATCCAAAGCTAAAGAGCTTCACCCCTCAAGAAGAGGAGCTCATCATCCAGCTGCATGCCGTCCTCGGTAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806351.1
MVKTSSSELHKAAWNEDGDAKMAAAFASKQRGTGNWTTSSKRSGQRRSGKNCRERWGNNQKPADPKLKSFTPQEEELIIQLHAVLGSRWPIIAQQLPEKTESDVKILWNSKLKKKLSAMGIDPVTHKPFSQILADYGSMGAFRLHPLSRDLKGALPAAAGPVKAELSDPQLDAEEASASSFSWSDFFLEEAFAAQQNGGHFDDDEILQGKGDTKIDGAAGFDAAPSSSSAFVEAMIGKQDEMCSQLPCFYEEPFYY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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