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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002090`

染色体: Chr04 坐标: 33713612-33714931 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002090`
名称	SmilChr04G002090
描述	uncharacterized SmilChr04G002090
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	33713612 - 33714931 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021258`
GeneID	`131021258`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021258`
原始查询	`LOC131021258`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Dynein light chain type 1 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832133]; symbol=AT5G20110; hit=AT5G20110; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Dynein light chain type 1 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832133]; symbol=AT5G20110; hit=AT5G20110; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G20110` (AT5G20110) Dynein light chain type 1 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832133] identity=71.4; qcov=0.37; evalue=5.55e-41; confidence=low
Rice	`Os01g0555600` - identity=55.5; qcov=0.447; evalue=8.33e-41; confidence=low
GO	GO:0007017 (microtubule-based process); GO:0030286 (dynein complex); GO:0045505 (dynein intermediate chain binding); GO:0051959 (dynein light intermediate chain binding)
KEGG	-
Pfam	PF01221 (Dynein_light)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021258

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057806352.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057806352.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057806352.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806352.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806352.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:33714102`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,B86
`Chr4:33714157`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,C1,C72
`Chr4:33714175`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr4:33714327`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B88,D11
`Chr4:33714490`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr4:33714662`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B54
`Chr4:33714662`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806352.1

246 aa

123

246

Dynein_light

PF01221 Dynein_light 155-240 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806352.1`	Pfam	`PF01221`	Dynein_light	Domain	155	240	1.7e-27	96.4	Dynein light chain type 1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950369.1
GTACCACATGGAGTTTGAAGAGATTGAGATGCAGATCAGGTCAACATTTACACAACCACTCCCCTTCTCCTCCGCACCCAGCGCATTTTAGAACCAATCCCCAGCAAACAGATATCATTACAAGTCTAGTCCACATCCAAATGTACCTCTCTGTCTCTCTCTCTCTCTCAACACACACACACACACACACACACAGTATACCCTATTCAAGAGTTAATCTTCCCCACACCACACCATAACTTTTAGCTTTCGCTCTATCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021258
ATGGCGCATCAGGCCAGCCACAGGCGCATCTTAGCAGCTCCAGACTCCATGGATCCCACACCAAGAAAACCCAAACCCAACCCTTCCTCCGGCGCCGGCCACCGCCACCGCCACCCAGATCCCTCCACCATCCAATCCATCTCCCACCGCTTCTCCAAACTCTACACAAACAACAGGAAACTCGCCTCCAAACCCCATCCGCACCCCCAACCCGACCCGAATCTCCACGACACGTCATGCGCCACCCTCACGAAATCCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806352.1
MAHQASHRRILAAPDSMDPTPRKPKPNPSSGAGHRHRHPDPSTIQSISHRFSKLYTNNRKLASKPHPHPQPDPNLHDTSCATLTKSSSQHGSVFSAPEKNQLVVSSKINDDLDAEKEKIGRNCVSSIPPSVNGGRRRSFCSSQVELADFLSCSGVKVVAVDMPPFMQIHAVNCARKARDSLEKFTSKTLAFTLKKEFDGVYGPAWHCIVGTSFGSFVTHSVGGFMYFSMDQKLYILLFKTAVQRAE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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