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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002084`

染色体: Chr04 坐标: 33598622-33600645 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002084`
名称	SmilChr04G002084
描述	two-component response regulator ARR5-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	33598622 - 33600645 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021261`
GeneID	`131021261`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021261`
原始查询	`LOC131021261`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	two-component response regulator ARR5-like
产物	two-component response regulator ARR5-like
Arabidopsis	`AT3G48100` (RR5) response regulator 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823965] identity=63.9; qcov=0.837; evalue=1.62e-71; confidence=high
Rice	`Os01g0952500` (RR4) - identity=60.1; qcov=0.708; evalue=2.1e-52; confidence=high
GO	GO:0000160 (phosphorelay signal transduction system); GO:0009736 (cytokinin-activated signaling pathway)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00072 (Response_reg)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021261

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806354.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806354.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806354.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806354.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057806354.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:33598941`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr4:33599017`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,D7
`Chr4:33599019`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:33599177`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr4:33599572`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B138,B59,B91,C76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806354.1

202 aa

101

202

Response_reg

PF00072 Response_reg 20-138 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806354.1`	Pfam	`PF00072`	Response_reg	Domain	20	138	2.3e-20	73.5	Response regulator receiver domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950371.1
TCACACGTTATTGCACCCGTACAGCGCTGTCGCAAATCATTATTAAACCAACAAAATAATGGCAAAAATCTTGATTTTTCTCCCCCATTTTTTTATTGTGTTTCAGGAGTTGAAACTGTCAGATAAAAGCGACAAGTCGGATATAATGCGAAGTAGATTTGCAAAGATTTCCCCTGTCTCTGCTTTTTGCCTTTTCGTTTCCCTAAAAGCAGATCTCTTTCTCTCTCTGTGATCTTACAAACCCACCATCCATTCATTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021261
ATGTCTGTGGAGGATATCGGGAGCGACTGCTCTTCAAGTGGTGATCAAGAATTCCATGTTCTCGCTGTGGATGACAGCCTTATTGACAGGAAGGTCATTGAGCGCTTGCTCAAGATTTCTTGCTGCAAAGTGACTGCTGTGGAAAGTGGGAGTCGAGCTCTGCAGTATTTGGGTATAGATGGAGAGAGAAGCTCTCTTGGATTTGATGAGTTGAAGGTGAATCTGATAATCACGGACTACTCCATGCCTGGAATGACTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806354.1
MSVEDIGSDCSSSGDQEFHVLAVDDSLIDRKVIERLLKISCCKVTAVESGSRALQYLGIDGERSSLGFDELKVNLIITDYSMPGMTGYELLKRIKGSTKLRQIPVVIMSSENILARIDRCLEEGAEDFLMKPVKLSDVERLRDFMLRGGETKVGRKRKMRDDSFSSSLLSSCDCDHPLSPISVSGMAHHKPLRKRSRLLATE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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