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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002125`

染色体: Chr04 坐标: 34258065-34262668 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002125`
名称	SmilChr04G002125
描述	protein QUIRKY
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	34258065 - 34262668 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021282`
GeneID	`131021282`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021282`
原始查询	`LOC131021282`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein QUIRKY
产物	protein QUIRKY
Arabidopsis	`AT1G74720` (QKY) C2 calcium/lipid-binding plant phosphoribosyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843811] identity=68.9; qcov=1.07; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0587300` - identity=64.3; qcov=0.87; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00168 (C2); PF08372 (PRT_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021282

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057806390.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057806390.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.60000	`XP_057806390.1`
4	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057806390.1`
5	Vesicle	囊泡	0.20000	`XP_057806390.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:34259285`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr4:34259350`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	137	A1,A10,A11,A13,A15,A16,A18,A19,A2,A20,A22,A23,A25,A3,A5,A6,A8,B100,B102,B104,B105,B11,B110,B111,B112,B114,B117,B120,B121,B122,B123,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B132,B133,B137,B140,B16,B17,B2,B22,B23,B24,B25,B26,B3,B32,B34,B35,B38,B39,B40,B44,B45,B47,B48,B49,B50,B52,B54,B55,B56,B58,B59,B60,B62,B63,B66,B67,B68,B69,B73,B8,B80,B81,B84,B86,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B96,B99,C1,C10,C13,C14,C17,C2,C21,C23,C24,C25,C26,C29,C31,C34,C35,C37,C38,C4,C41,C43,C45,C54,C55,C56,C57,C6,C64,C66,C67,C7,C71,C72,C77,C79,C8,C82,C83,C84,C86,C87,C9,D10,D11,D3,D5,D9
`Chr4:34259354`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C37
`Chr4:34259393`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr4:34259520`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C23,D10
`Chr4:34259625`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C32,C68,C73
`Chr4:34259689`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	64	A1,A24,A4,A7,A9,B105,B124,B127,B130,B139,B14,B15,B16,B21,B28,B30,B31,B35,B36,B37,B44,B53,B64,B70,B71,B78,B82,B93,C16,C17,C18,C19,C21,C22,C27,C30,C31,C32,C33,C35,C36,C42,C44,C45,C46,C47,C48,C50,C53,C58,C59,C61,C62,C65,C68,C71,C73,C74,C8,C84,D11,D3,D4,D6
`Chr4:34259707`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B110,B5,C83
`Chr4:34259752`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,C57
`Chr4:34259769`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:34259920`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr4:34259974`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C32,C68,C73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806390.1

949 aa

474

949

PRT_C

PF00168 C2 220-324 aa PF00168 C2 382-491 aa PF00168 C2 537-648 aa PF08372 PRT_C 794-949 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806390.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	220	324	9.6e-40	135.7	C2 domain
`XP_057806390.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	382	491	9.6e-40	135.7	C2 domain
`XP_057806390.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	537	648	9.6e-40	135.7	C2 domain
`XP_057806390.1`	Pfam	`PF08372`	PRT_C	Family	794	949	3.2e-70	235.6	Plant phosphoribosyltransferase C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950407.1
AATGAGTAGCATTAAGAAATAATGCAGTAGTGTAAACAGGAAGATTTTTATTGAGGACCCAAAACCATAAAGGAGGTGCGAAACGAAAAGTGGGAGGATAAAATATGAAAAAAGTGAGAAAACTTCATATGAGAGAATGGAATCCAATCTCTCTCACTACGCACGCACGCACAGTGCACAAAACAAAATACTAACTGTCACATTCCACAACACTCCACCGCCAAAACATTCACAGCTAGAAAAGATCTCTCGAAAGAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021282
ATGGATTACGAGGAGCTGAACGTGGAGGTTTTCAATGATAAGAAGCTCAGCAATGGCAATGCGAGGAAGAATCATTTTCTGGGGAGAGTGAAATTGTATGGATCGCAGTTCGTCAAGAGAGGGGAAGAAGGATTGGTGTATTTTACGCTGGAGAAGAAGAGTGTGTTCAGTTGGATTAAAGGGGAATTAGGGTTGAAGATTTATTACTACGATGAGATTATGGAGGAGCAGCCTCCGCCGGCGCCTGAGGACCAACCTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806390.1
MDYEELNVEVFNDKKLSNGNARKNHFLGRVKLYGSQFVKRGEEGLVYFTLEKKSVFSWIKGELGLKIYYYDEIMEEQPPPAPEDQPPPPAEQQQQPPPQLQPEEVMKKPVFVVSEDQPPPPMEMREHSPPMIRIHEPRVHEPPPDNAPPPDNIPPPGFSPDMRRMQMGGNGMPGPMAGERVKVLRRPGNGDYSPRIIAGKFKGDTSERIQAFDLVEPMQYLFVRIVKGRGLSPSENPHVRVRTSGHFVRTKPAVPPPGGD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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