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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002134`

染色体: Chr04 坐标: 34324413-34330428 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002134`
名称	SmilChr04G002134
描述	tRNase Z TRZ1
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	34324413 - 34330428 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021292`
GeneID	`131021292`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021292`
原始查询	`LOC131021292`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tRNase Z TRZ1
产物	tRNase Z TRZ1
Arabidopsis	`AT1G74700` (TRZ1) tRNAse Z1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843809] identity=70; qcov=0.922; evalue=8.58e-151; confidence=high
Rice	`Os02g0214300` (TRZ1) - identity=60.6; qcov=1; evalue=8.31e-142; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12706 (Lactamase_B_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021292

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806401.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057806401.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057806401.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057806401.1`
5	Nucleolus	核仁	0.20000	`XP_057806401.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:34324803`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B18,B69,D7
`Chr4:34324825`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B30,B35
`Chr4:34327370`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:34327528`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,C1,C72
`Chr4:34327571`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B18,B69,D7
`Chr4:34327572`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C37,D10
`Chr4:34328045`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806401.1

307 aa

154

307

Lactamase_B_2

PF12706 Lactamase_B_2 76-276 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806401.1`	Pfam	`PF12706`	Lactamase_B_2	Domain	76	276	2.3e-11	44.4	Beta-lactamase superfamily domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950418.1
CTCCTTTGTTTCCTCTCTCCATCACGCTCGACTCTCTCTTTCTCTCGCCATCCCTTTTCCTCTCTGTCTCCTCGCCGCTGCTGGCGCCACTTCTCAGTCCCGGCGTCGCCTCCTCCTCCTACCCTGATTCAAAACACCAACCCCCTAAATTCTCCCAATTCCTCAAACCCTTCTCCTCAAATCCTAAATTTCTCTGGAATACCAAATTTTCTCCTTCTCTATTTCTCACCATCTCGATCAATTCTAAACCAAGCGACAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021292
ATGGCATCCGGTGGCGAAACTGCGCGGGAGTCTATCGACGTGATATCGGAGAGGCAGAAACAGCAGAAGAAGAAAAAGAAGAGAGCTGGCGAGGAAGACCTGCAAATCGAGGGCTACTCAATCGGGGGATTGTCGATAGCGGGGCATGAGACTTGCGTGATTCTGCCCTCTCTCAACTTGGCGTTTGATATTGGCAAGTGCCCCCAGTGTGCCATTTCGCAGCAGTTCCTCTTCATCTCCCACGGCCACATGGACCACAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806401.1
MASGGETARESIDVISERQKQQKKKKKRAGEEDLQIEGYSIGGLSIAGHETCVILPSLNLAFDIGKCPQCAISQQFLFISHGHMDHIGGLPMYVATRGLYRMAPPTIIVPKVIKESVEKIFEAHRVMDHSELEHTLVGLDVGEEFSIRKDLKVRAFRTYHAIPSQGYIVYSVRQKLKQEYLGRPGAELKGLRLSGIEITDTYTTPEIAFTGDTMSDFITDVDNADVLRAKILIMESTYVDDLCMVEHAREYGHTHLSEII...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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