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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002138`

染色体: Chr04 坐标: 34390800-34393837 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002138`
名称	SmilChr04G002138
描述	ubiquitin-conjugating enzyme E2 2-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	34390800 - 34393837 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021296`
GeneID	`131021296`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021296`
原始查询	`LOC131021296`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ubiquitin-conjugating enzyme E2 2-like
产物	ubiquitin-conjugating enzyme E2 2-like
Arabidopsis	`AT2G02760` (UBC2) ubiquiting-conjugating enzyme 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814805] identity=92.1; qcov=1; evalue=3.85e-105; confidence=high
Rice	`Os07g0166800` (OsUBC7) - identity=92.1; qcov=1; evalue=2.68e-105; confidence=high
GO	-
KEGG	smil04120 (Ubiquitin mediated proteolysis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00179 (UQ_con)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021296

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806406.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057806406.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057806406.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057806406.1`
5	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057806406.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:34391785`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr4:34391842`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B33,B87,C39,C48,C61
`Chr4:34391982`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C73
`Chr4:34391982`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C73
`Chr4:34392005`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B123
`Chr4:34392376`	`G`	`GTC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806406.1

152 aa

152

UQ_con

PF00179 UQ_con 8-144 aa

XP_057806407.1

152 aa

152

UQ_con

PF00179 UQ_con 8-144 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806406.1`	Pfam	`PF00179`	UQ_con	Domain	8	144	1.4e-52	177.7	Ubiquitin-conjugating enzyme
`XP_057806407.1`	Pfam	`PF00179`	UQ_con	Domain	8	144	1.4e-52	177.7	Ubiquitin-conjugating enzyme

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950423.1
ATAAGGATAAAAAACTAAAATAACGCCAAGAGTACGCATACCGCATACACATGCATATATATTAGTAATTTAATGGAATTTTCTCTCTCCTCTTCACTTCACAGTTTCTTTTCCACCTCTTCTGCGAGAGGACTCCTTTGAAGTTCTATCATAGGTATTTGAGATGTCAACTGCAGCCAGGAAGAGACTGATGAGGGACTTCAAGGGGTTGCAGCAGGACCCACCTGCGGGCATCAGTGGCGCTCCACAAGAGAATAATA...

XM_057950424.1
AGAAGCGATCCCTTGGAATTTATAGCTATTTAAAGACTGGAACTGGGCAGCTCACCTTGAAAACTCTAACTATAGTTTTTGTATTTGAGATGTCAACTGCAGCCAGGAAGAGACTGATGAGGGACTTCAAGGGGTTGCAGCAGGACCCACCTGCGGGCATCAGTGGCGCTCCACAAGAGAATAATATTATGCTCTGGAACGCGGTTATATTTGGTCCAGATGACACGCCTTGGGATGGAGGTACGTTTAGAATGACTCTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131021296
ATGTCAACTGCAGCCAGGAAGAGACTGATGAGGGACTTCAAGGGGTTGCAGCAGGACCCACCTGCGGGCATCAGTGGCGCTCCACAAGAGAATAATATTATGCTCTGGAACGCGGTTATATTTGGTCCAGATGACACGCCTTGGGATGGAGGTACGTTTAGAATGACTCTTCAGTTCATAGAAGAATATCCAAACAAGCCACCAACTGTTCGGTTTGTTTCTCGAATGTTCCATCCAAATATTTATGCGGATGGAAGTAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057806406.1
MSTAARKRLMRDFKGLQQDPPAGISGAPQENNIMLWNAVIFGPDDTPWDGGTFRMTLQFIEEYPNKPPTVRFVSRMFHPNIYADGSICLDILQNQWSPIYDVAAILTSIQSLLSDPNPNSPANSEAARMFNENKREYNRRVREIVEQSWTAD

XP_057806407.1
MSTAARKRLMRDFKGLQQDPPAGISGAPQENNIMLWNAVIFGPDDTPWDGGTFRMTLQFIEEYPNKPPTVRFVSRMFHPNIYADGSICLDILQNQWSPIYDVAAILTSIQSLLSDPNPNSPANSEAARMFNENKREYNRRVREIVEQSWTAD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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