当前解析结果
SmilChr04G002159| 统一新 Gene ID | SmilChr04G002159 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G002159 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G002159 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 34652796 - 34653194 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131021312 |
|---|---|
| GeneID | 131021312 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131021312 |
| 原始查询 | LOC131021312 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835817]; symbol=AT5G57123; hit=AT5G57123; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835817]; symbol=AT5G57123; hit=AT5G57123; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT5G57123 (AT5G57123)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835817] identity=62.7; qcov=0.967; evalue=5.57e-25; confidence=medium |
| Rice | Os06g0660400- identity=62.5; qcov=0.918; evalue=1.06e-19; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131021312 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 0.60000 | XP_057806427.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057806427.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057806427.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057806427.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057806427.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:34652928 |
CAA |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 3 | B129,B89,C26 |
Chr4:34652928 |
CAA |
C |
2bp_deletion | CDS_variant | 3 | B129,B89,C26 |
Chr4:34652941 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B95 |
Chr4:34652946 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A3,C2,C83 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。