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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002178`

染色体: Chr04 坐标: 35183814-35188552 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002178`
名称	SmilChr04G002178
描述	uncharacterized SmilChr04G002178
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	35183814 - 35188552 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021327`
GeneID	`131021327`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021327`
原始查询	`LOC131021327`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ypt/Rab-GAP domain of gyp1p superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829118]; symbol=AT4G29950; hit=AT4G29950; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Ypt/Rab-GAP domain of gyp1p superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829118]; symbol=AT4G29950; hit=AT4G29950; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G29950` (AT4G29950) Ypt/Rab-GAP domain of gyp1p superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829118] identity=52.8; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0518100` (MAP) - identity=48.1; qcov=1.06; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005096 (GTPase activator activity); GO:0090630 (activation of GTPase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00566 (RabGAP-TBC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021327

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057806458.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057806458.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057806458.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806458.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806458.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:35184030`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,C73
`Chr4:35184786`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr4:35184787`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr4:35184978`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,C41
`Chr4:35184991`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,B79
`Chr4:35185238`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B36
`Chr4:35185238`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B36
`Chr4:35185240`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr4:35185257`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr4:35185661`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B5,B52,C46,C83
`Chr4:35185968`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B137,B80,C41
`Chr4:35186124`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	51	A11,A15,A21,A25,A4,A9,B110,B115,B121,B127,B135,B18,B20,B21,B23,B27,B30,B33,B40,B43,B50,B55,B58,B59,B60,B63,B66,B68,B72,B74,B76,B85,B86,B88,B9,B95,B97,C13,C20,C29,C30,C54,C62,C70,C71,C74,D1,D6,D7,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806458.1

805 aa

402

805

RabGAP-TBC

PF00566 RabGAP-TBC 104-161 aa PF00566 RabGAP-TBC 254-353 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806458.1`	Pfam	`PF00566`	RabGAP-TBC	Family	104	161	1.3e-22	81.3	Rab-GTPase-TBC domain
`XP_057806458.1`	Pfam	`PF00566`	RabGAP-TBC	Family	254	353	1.3e-22	81.3	Rab-GTPase-TBC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950475.1
AATGGTTAGTTATATTATACCGCAAAGCATCTATTTGTTCCGTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCACCTTCGCTTCCTCTCTCTAGATTTCTGCTTCTCTGTTGTAAAAGTTTCTCCATTTCTCCACCCAAAACCTTTGCCTGGATTTTCTCTAAATCTTTTCAGCTTTTCTCAATTTCATGCACTCGCCATCGTTTCTAATTGATTTCGATACGCCCTCTCATCGTCATGCTAAACGGTTCACCGGAAATCCGATTCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021327
ATGGAAACTGTAATGCCGGAAACTGCAATGCCGGAAACGGCATCATGTGCACGCCGTTTTGCTGCCCTTAGAGGGGTCAAATGGCGCGTGGATTTGGGGATTTTACCATCTTCTCCTTCTGCAACCATCGACGATCTTCGCCGCGTCACCGCCGATTCTCGGAGAAGGTATGCTGCATTGAGGAGACAACTTCTGGTTGATCCACATGTGCCGAAAGATGGAAGTAGTTCTCCTGATCCCGTCATAGACAATCCACTGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806458.1
METVMPETAMPETASCARRFAALRGVKWRVDLGILPSSPSATIDDLRRVTADSRRRYAALRRQLLVDPHVPKDGSSSPDPVIDNPLSQNPDSMWGRFFRNAELERMVDQDLTRLYPERGSYFQTSGCQGILRRILLLWCLSHPEYGYRQGMHELLAPLVYVLHVDLERLSEVRKNYEDHFVDNFDGFSFHENDLTYKFEFKKFSESVEDGSKSKKSPKIASLTELDPVIQTIILLSDAYGAEGELGIVLSEKFMEHDAYS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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