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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002186`

染色体: Chr04 坐标: 35301299-35320433 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002186`
名称	SmilChr04G002186
描述	oxysterol-binding protein-related protein 4B
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	35301299 - 35320433 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021338`
GeneID	`131021338`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021338`
原始查询	`LOC131021338`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	oxysterol-binding protein-related protein 4B
产物	oxysterol-binding protein-related protein 4B
Arabidopsis	`AT4G25850` (ORP4B) OSBP(oxysterol binding protein)-related protein 4B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828691] identity=51.6; qcov=0.843; evalue=1.81e-138; confidence=high
Rice	`Os08g0517700` (P0700D12.114-2) - identity=51.9; qcov=0.825; evalue=1.01e-135; confidence=high
GO	GO:0005829 (cytosol); GO:0015248 (GO:0015248); GO:0016020 (membrane); GO:0032934 (sterol binding); GO:0043231 (intracellular membrane-bounded organelle)
KEGG	-
Pfam	PF01237 (Oxysterol_BP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021338

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	0.60000	`XP_057806477.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057806477.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057806477.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057806477.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806477.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:35301395`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr4:35301464`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	A18,A6,B11,B113,B114,B45,B47,B7,B72,B73,B80,B97,C11,C26,C3,C64,C66,C69
`Chr4:35301488`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A7,B30,B35,B55,C23
`Chr4:35301488`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A7,B30,B35,B55,C23
`Chr4:35301520`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,C2
`Chr4:35301530`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	20	A13,A21,A25,B110,B118,B12,B125,B138,B21,B3,B31,B5,B51,B76,B95,C13,C25,C46,C58,C83
`Chr4:35317245`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B69,B91
`Chr4:35317600`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr4:35320076`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr4:35320279`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806477.1

446 aa

223

446

Oxysterol_BP

PF01237 Oxysterol_BP 102-429 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806477.1`	Pfam	`PF01237`	Oxysterol_BP	Family	102	429	3.4e-54	184.8	Oxysterol-binding protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950494.1
AGCAGGAAATTATTAGATTTGTGGTAAGTTAGTAAGGAGGGAGACTTAGACGAAATGTTTAGCTTTATATTTATTGTTCCTTTTCCCGTGGGAGAGGAAAAGCAGCAAGCAATGGCTTTAAAAAGCCTGAATCCTATATCTTCTCTGCACCATCACTCCTACACACAAAACCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAAGTTTCATTTACATACATCATCGCACTCTTCTCAAATGGTAAAAGAGAAGAGTTTGGACGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021338
ATGTTTAGCTTTATATTTATTGTTCCTTTTCCCGTGGGAGAGGAAAAGCAGCAAGCAATGGCTTTAAAAAGCCTGAATCCTATATCTTCTCTGCACCATCACTCCTACACACAAAACCATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAAGTTTCATTTACATACATCATCGCACTCTTCTCAAATGGTAAAAGAGAAGAGTTTGGACGGAAAGGGCGGCGTAGTTCTAACTGCTCCGTTATCTCTTGACGGCAACGAATCCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806477.1
MFSFIFIVPFPVGEEKQQAMALKSLNPISSLHHHSYTQNHLSLSLSLSKFHLHTSSHSSQMVKEKSLDGKGGVVLTAPLSLDGNESDSDYRTPNIIQRILSLLAAVRPGSDLTRLQLPPQFNIPKSQLQLYGESVYSVRSNMLSKCVEEETPLGRLVAVVAWSISTLRPLPFGVAPYNPLLGETHHVSAASLNVLLEQVSHHPPVTALHATDEKANIEILWCQSPIPKFYGSHIETEVVGKRQLKLVEQKETYTLNSPKL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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