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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002193`

染色体: Chr04 坐标: 35474051-35476519 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002193`
名称	SmilChr04G002193
描述	uncharacterized SmilChr04G002193
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	35474051 - 35476519 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021343`
GeneID	`131021343`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021343`
原始查询	`LOC131021343`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ral transcription factor 2-related zinc finger protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822666]; symbol=AT3G29765; hit=AT3G29765; species=arabidopsis; confidence=high
产物	ral transcription factor 2-related zinc finger protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822666]; symbol=AT3G29765; hit=AT3G29765; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G29765` (AT3G29765) ral transcription factor 2-related zinc finger protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822666] identity=46.9; qcov=0.925; evalue=4.51e-159; confidence=high
Rice	`Os02g0301400` - identity=41.7; qcov=0.567; evalue=1.34e-71; confidence=medium
GO	GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF05699 (Dimer_Tnp_hAT); PF14291 (DUF4371)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021343

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806490.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057806490.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806490.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806490.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806490.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:35474066`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B49,B84,C73
`Chr4:35474134`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr4:35474161`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,B25,C23
`Chr4:35474188`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B110,B120,B122,B26
`Chr4:35474199`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B59,B79,C19
`Chr4:35474207`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B59,B79,C19
`Chr4:35474210`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A3,A9,B15,B19,B35,B74,B80,C4,C75,C86,D4
`Chr4:35474217`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,C19,C7
`Chr4:35474222`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B95,C26,C31,D2,D3
`Chr4:35474256`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B140,C11,C69
`Chr4:35474280`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B124,B88
`Chr4:35474280`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,B88

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806490.1

533 aa

266

533

DUF4371

Dimer_Tnp_hAT

PF14291 DUF4371 5-73 aa PF05699 Dimer_Tnp_hAT 411-470 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806490.1`	Pfam	`PF14291`	DUF4371	Domain	5	73	2.2e-31	110.0	ZMYM1/FAM200, RNase-like domain
`XP_057806490.1`	Pfam	`PF05699`	Dimer_Tnp_hAT	Domain	411	470	3.6e-06	27.4	hAT family C-terminal dimerisation region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950507.1
TATATATATATATATATATATATATAAAACGAAAACAAAAAACGGGGCAGCGTCACAGACTCACAAACCCTGGCCGCGAGAACCCACCCAGCTTGAACCCACCTTGCGCCGCCACCACCTGCCGCTCGCGCCACCGCCGTCGCACCACCGGTTCACCACGGCACCACCACTGTGCTGAATATGCTGATTCCACCTTCCATTTTAGAGATCAAGAGGGAGTTTGTTGAAATTAGCATATGCGAATTTTATTTGTGAATTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021343
ATGTGGAAACTGAAACAAATGGGGGTAGTTTTAAGATATGTGAATGATAAAGAATGTGTAATTGAAAGATTTATTGGCATTGTGCATGTTGTTGACACTTGTTCACATTCTCTTAAAGATGCTCTTAGTGCTTTATTTGTGAAACATGGTTTATCACTATCAAAACTGAGAGGTCAAGGATATGATGGAGCTTCAAACATGAGAGGTGAGTTCAATGGGTTGAAGGCCTTAATATTGGAAGAAAATCCTTATGCTATGTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806490.1
MWKLKQMGVVLRYVNDKECVIERFIGIVHVVDTCSHSLKDALSALFVKHGLSLSKLRGQGYDGASNMRGEFNGLKALILEENPYAMYIHCFSHQLQLIVVVVAKSIIAVKDCFSYVSMIVNTTGASCKRKDQLRMLEHERLVKELNDEVRTSGKGQNQETSLVRPGDTRWGSHYVTLLRLCAMWPSVEKVLENIRDDTTSSEVRSTARGLLRKMNDYEFVFVMHLMKYLLGITNELSYALQRRDQNIVQAMILIDAVKSQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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