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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002223`

染色体: Chr04 坐标: 35919337-35921502 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002223`
名称	SmilChr04G002223
描述	uncharacterized SmilChr04G002223
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	35919337 - 35921502 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021371`
GeneID	`131021371`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021371`
原始查询	`LOC131021371`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Uncharacterized conserved protein UCP015417, vWA [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831161]; symbol=AT5G13210; hit=AT5G13210; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Uncharacterized conserved protein UCP015417, vWA [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831161]; symbol=AT5G13210; hit=AT5G13210; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G13210` (AT5G13210) Uncharacterized conserved protein UCP015417, vWA [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831161] identity=57.8; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0179600` - identity=54.1; qcov=0.961; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF11443 (DUF2828); PF25043 (DUF7788)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021371

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057806518.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057806518.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057806518.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806518.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806518.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:35919524`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr4:35919568`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C64
`Chr4:35919568`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C64
`Chr4:35919571`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr4:35919581`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr4:35919591`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr4:35919804`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,C58,D4
`Chr4:35920278`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B100
`Chr4:35920278`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B100
`Chr4:35920299`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr4:35920342`	`A`	`ACT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B84
`Chr4:35920342`	`A`	`ACT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806518.1

664 aa

332

664

DUF2828

DUF7788

PF11443 DUF2828 88-462 aa PF25043 DUF7788 464-644 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806518.1`	Pfam	`PF11443`	DUF2828	Repeat	88	462	3.2e-137	458.4	Domain of unknown function (DUF2828)
`XP_057806518.1`	Pfam	`PF25043`	DUF7788	Domain	464	644	1.3e-81	273.9	Domain of unknown function (DUF7788)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950535.1
AATGTCAAAAACTCATCTACACTTATACAGAAAGAGAACTTCTAAAACCCCCCTTTTCACAATCATGGCTGCCGCTCTTCTCGTCGGGCCACCGGAGATCTATCAAAAACCACCCAAATCCACAACCGTGCCCGTCGATGTCGCCATGGAAGCCGACATCACCGCCTCCGCCGACGTCTCCGGCACGGGCGATGCATTCGTCGACCTTATGGTCGCAGAATTTAACAAAACAGCAACCTACGTACCCCCTCTGAGGGGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021371
ATGTCAAAAACTCATCTACACTTATACAGAAAGAGAACTTCTAAAACCCCCCTTTTCACAATCATGGCTGCCGCTCTTCTCGTCGGGCCACCGGAGATCTATCAAAAACCACCCAAATCCACAACCGTGCCCGTCGATGTCGCCATGGAAGCCGACATCACCGCCTCCGCCGACGTCTCCGGCACGGGCGATGCATTCGTCGACCTTATGGTCGCAGAATTTAACAAAACAGCAACCTACGTACCCCCTCTGAGGGGACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806518.1
MSKTHLHLYRKRTSKTPLFTIMAAALLVGPPEIYQKPPKSTTVPVDVAMEADITASADVSGTGDAFVDLMVAEFNKTATYVPPLRGLTENRSPTFLSTGNPCLDFFFHIVPDTPPESLTNRLKLAWDQDPLKALKLVCNLRGVKGTGKSDKEGFYTAALWLHEHHPKTLAGNAAAFADFGYYKDLLEILFRVLEGAEARKLAKAMGELWKSRTHKRKSGIHKGRKRGVRFPRGVRSSTETAPLHGAKKSTSEEKRIERAK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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