当前解析结果
SmilChr04G002232| 统一新 Gene ID | SmilChr04G002232 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G002232 |
| 描述 | mitochondrial import receptor subunit TOM7-1-like |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 36032423 - 36033049 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131021377 |
|---|---|
| GeneID | 131021377 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131021377 |
| 原始查询 | LOC131021377 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | mitochondrial import receptor subunit TOM7-1-like |
| 产物 | mitochondrial import receptor subunit TOM7-1-like |
| Arabidopsis | AT5G41685 (AT5G41685)Mitochondrial outer membrane translocase complex, subunit Tom7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834171] identity=58.8; qcov=1.03; evalue=9.38e-23; confidence=medium |
| Rice | Os01g0626300- identity=68.8; qcov=1.03; evalue=4.82e-32; confidence=medium |
| GO | GO:0005742 (mitochondrial outer membrane translocase complex); GO:0030150 (protein import into mitochondrial matrix) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF08038 (Tom7) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131021377 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057806521.1 |
| 2 | Mitochondrion membrane | 线粒体膜 | 1.00000 | XP_057806521.1 |
| 3 | Mitochondrion inner membrane | 线粒体内膜 | 0.20000 | XP_057806521.1 |
| 4 | Mitochondrion outer membrane | 线粒体外膜 | 0.20000 | XP_057806521.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057806521.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:36032740 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A19,B83,B94,C79 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057806521.1PF08038
Tom7 36-75 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057806521.1 |
Pfam | PF08038 |
Tom7 | Family | 36 | 75 | 2.4e-19 | 69.5 | TOM7 family |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。