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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002239`

染色体: Chr04 坐标: 36156656-36164001 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002239`
名称	SmilChr04G002239
描述	auxin response factor 19-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	36156656 - 36164001 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021383`
GeneID	`131021383`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021383`
原始查询	`LOC131021383`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	auxin response factor 19-like
产物	auxin response factor 19-like
Arabidopsis	`AT1G19220` (ARF19) auxin response factor 19 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838505] identity=67.7; qcov=0.466; evalue=0; confidence=medium
Rice	`Os02g0141100` (OsARF5) - identity=67.1; qcov=0.487; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0009725 (response to hormone)
KEGG	-
Pfam	PF02309 (AUX_IAA); PF02362 (B3); PF06507 (ARF_AD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021383

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806535.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806535.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806535.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806535.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057806535.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:36158832`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C82
`Chr4:36158832`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C82
`Chr4:36160268`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B88,D4
`Chr4:36160272`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr4:36161158`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C21,C29
`Chr4:36161249`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:36161372`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr4:36161547`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr4:36161561`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	31	A14,A21,B103,B105,B106,B130,B14,B140,B15,B19,B22,B49,B5,B54,B59,B61,B63,B79,B9,C17,C20,C24,C28,C33,C35,C42,C52,C65,C71,C80,C84
`Chr4:36161580`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B76,C49
`Chr4:36161652`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr4:36161998`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C39,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806535.1

1110 aa

555

1110

ARF_AD

AUX_IAA

PF02362 B3 132-234 aa PF06507 ARF_AD 281-364 aa PF02309 AUX_IAA 998-1083 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806535.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	132	234	7e-22	78.0	B3 DNA binding domain
`XP_057806535.1`	Pfam	`PF06507`	ARF_AD	Domain	281	364	4.3e-34	117.0	Auxin response factor ancillary domain
`XP_057806535.1`	Pfam	`PF02309`	AUX_IAA	Family	998	1083	1.4e-06	29.0	AUX/IAA family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950552.1
ACTACACACGCTTACCCGAGTAATTATGAGAACTCTCCTCGGTAATAATAGCATCTATGAATCTCGTACCATTTACTTCACTGGTCAACTTTGCGTTGCCATACCTAAATCTAGAGAGAGAAAGGAGCGCAGAGGATACAGCAGGTTGTGTAGAGGGAGAAGCAAAGACCAGGGCAGAGAAAGGAGAGAGAGACAGAGACAGCACATGCACAATCCCAGCAAATCTCAGTTTAATTGAAAGATACATATACAGAGGGAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021383
ATGAAGGCACCAAACTCCGGCAGCGGAGCTCCGCCGTCGAACGTCTCCGCCGCTGAAGGTGAGAAGAAGAGTATAAATTGTGAGCTATGGCAAGCCTGCGCCGGACCACTAGCAAACCTGCCGGCGGCTGGGACCCACGTCGTCTACTTTCCTCAAGGCCACAGCGAACAGGTTGCTGCTTCCATGAAAAAGGATGCCAATGCACAAATCCCTAACTACCCAAATCTTCCCTCGAAACTAATATGCCTTCTTCACAGTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806535.1
MKAPNSGSGAPPSNVSAAEGEKKSINCELWQACAGPLANLPAAGTHVVYFPQGHSEQVAASMKKDANAQIPNYPNLPSKLICLLHSVTLHADPETDEVYAQMTLQPVPTFDQDSLLRSDLSMKVNKPQTEFFCKTLTASDTSTHGGFSVPRRAAEKIFPSLDFSMQPPAQEIVARDLHDTVWTFRHIFRGQPKRHLLTSGWSLFVSGKRLIAGDSVLFIRDEKQQLLLGIRRANRQPTNLSSSVLSSDSMHIGVLAAAAH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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