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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002253`

染色体: Chr04 坐标: 36492325-36512064 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002253`
名称	SmilChr04G002253
描述	uncharacterized SmilChr04G002253
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	36492325 - 36512064 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021398`
GeneID	`131021398`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021398`
原始查询	`LOC131021398`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	SH3 domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815305]; symbol=AT2G07360; hit=AT2G07360; species=arabidopsis; confidence=high
产物	SH3 domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815305]; symbol=AT2G07360; hit=AT2G07360; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G07360` (AT2G07360) SH3 domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815305] identity=75.7; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0265700` - identity=75.3; qcov=0.891; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00018 (SH3_1); PF30965 (TSAUCER_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021398

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057806566.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057806566.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057806566.1`
4	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.40000	`XP_057806566.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806566.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:36493715`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr4:36493829`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,C21,C29
`Chr4:36495500`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B90,B92,C87
`Chr4:36497454`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B74
`Chr4:36497454`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B74
`Chr4:36497492`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr4:36499845`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C59,C84
`Chr4:36499856`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B136,C24,C76,D1
`Chr4:36499890`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,C77
`Chr4:36499906`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B118
`Chr4:36499906`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B118
`Chr4:36500950`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806566.1

1209 aa

604

1209

TSAUCER_N

SH3_1

PF30965 TSAUCER_N 83-469 aa PF00018 SH3_1 1154-1194 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806566.1`	Pfam	`PF30965`	TSAUCER_N	Repeat	83	469	5.3e-220	730.9	TSET complex tstB/TSAUCER-like N-terminal domain
`XP_057806566.1`	Pfam	`PF00018`	SH3_1	Domain	1154	1194	7.9e-08	32.5	SH3 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950583.1
AGTAACTAGTAAATGAGTTGAAATTTTGAAGAATAGTTGTTGCTGTACAGTGCAGCCGTGGTAAGGAAAGTATTCTGTCCTGAAAAATTGAAAATCAGGATCAGATCACTCCACAAACAACCCCACCGTTTCTTCTGCTACTTCGCCGAGATTTGTCCATGGCGGAGTCATCGGGTACGACGCTCATGGATCTCATAACCTCGGATGGTTCGTCGTCGAAGCCTTCACCTGCGGCGTCGACTACGGCGCCGCCGCCCGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021398
ATGGCGGAGTCATCGGGTACGACGCTCATGGATCTCATAACCTCGGATGGTTCGTCGTCGAAGCCTTCACCTGCGGCGTCGACTACGGCGCCGCCGCCCGTTGATTCCGCGGCGTCAGCTGGCCCGCCGGTGCCGCTGGTGGCCGAGCGGAAGTCGAAGAAGGGGACTCTGATGCAGATCCAGAGTGACACCATCTCTGCTGCCAAGGCTGCTTTCAACCCAGTTCGCGCCAACATTATGCCCCAAAGGCAAAAGAAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806566.1
MAESSGTTLMDLITSDGSSSKPSPAASTTAPPPVDSAASAGPPVPLVAERKSKKGTLMQIQSDTISAAKAAFNPVRANIMPQRQKKKPVSYAQLARSIHELAASSDQKSSQRQLVHHVFPKLAVYNSVDPSLAPSLLMLDQQCEDRTVLRYVYYYLARILSDSGSQGLSPGGGIPTPNWDALADIDAVGGVTRADVVPRVVERLTTEALNEEVEFHPRRLQALKALTYAPSSNSEILSKVYEIVFSILEKVGEPQKRKKG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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