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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002255`

染色体: Chr04 坐标: 36516665-36517813 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002255`
名称	SmilChr04G002255
描述	uncharacterized SmilChr04G002255
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	36516665 - 36517813 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021399`
GeneID	`131021399`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021399`
原始查询	`LOC131021399`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12776 (Myb_DNA-bind_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021399

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806567.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806567.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806567.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806567.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057806567.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:36516980`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:36516984`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B121,B122,C65
`Chr4:36517037`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B28,B52
`Chr4:36517071`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr4:36517072`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr4:36517073`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B23,B33,B78,C64,C66
`Chr4:36517098`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr4:36517132`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr4:36517139`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B64,C9
`Chr4:36517162`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr4:36517170`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr4:36517188`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806567.1

244 aa

122

244

Myb_DNA-bind_3

PF12776 Myb_DNA-bind_3 17-111 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806567.1`	Pfam	`PF12776`	Myb_DNA-bind_3	Domain	17	111	1.8e-06	29.5	Myb/SANT-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950584.1
TTACTTTTTGAGAATGGAATATAAGTTAATGTTTATTTATGTCACACATCTCATCTCTTATTGGTCTGTCAAGTTATTCCATCAACTTAAATGCCATGCTGTAATATGACTATGTTCTTGCACCGCCATTTTGGGCATATTGCATATAAATCTGACTATCTTTTAAATGAAGCAACACCTACCATCAAATTGAAGCAATACTATTTGTTGCAAATTTAATGCCTGCGGTTGATAGTAAAGTTAATGCCCCAACCAAAAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021399
ATGAAGCTCTCAGAAATTCTAGACCAAACTTACTTCTTCTATGATCTCAAATGGAATGCCACCATGGATGCCAAGCTTCTGGACATTATGCTTGCGCACAAAGATGAGTGCTTCATGGCGCCAGTTCACAAGTCACCTCACGTGCATATTGAGGCATTAACGACTCTCAACAACTTGGGTAAGCCAGATAAGGAGTTGCATCTGATGGACGTCGAGGATCGCGCTGAGTTCCTCCATGGGCGTTTTCTGTGCTTCAAGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806567.1
MKLSEILDQTYFFYDLKWNATMDAKLLDIMLAHKDECFMAPVHKSPHVHIEALTTLNNLGKPDKELHLMDVEDRAEFLHGRFLCFKTIMNTPGAHWDQHTNCIIAAEKVWLKMIKDNNFAQAYYYSGEPEHRKMFNLFGSDEIKTELSHTVILISDTVPEQGKTIDLTQEVSSDDDVTSPSLVNVRKMRKKLTFGDNDAESTALGYETSPSRCECQCPQNNTPPTKGKNVEAGGSSCASCSPFK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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