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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002260`

染色体: Chr04 坐标: 36567529-36571167 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002260`
名称	SmilChr04G002260
描述	protein REPRESSOR OF SILENCING 3
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	36567529 - 36571167 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021404`
GeneID	`131021404`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021404`
原始查询	`LOC131021404`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein REPRESSOR OF SILENCING 3
产物	protein REPRESSOR OF SILENCING 3
Arabidopsis	`AT5G58130` (ROS3) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835925] identity=43.7; qcov=0.44; evalue=4.62e-59; confidence=low
Rice	`Os02g0138200` - identity=37.4; qcov=0.666; evalue=1.47e-65; confidence=medium
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0005634 (nucleus)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021404

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806572.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057806572.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806572.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806572.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806572.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:36567882`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr4:36568038`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B56,B96,C59,C84
`Chr4:36568146`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B40,B44,B98,C77,C80
`Chr4:36568177`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B40,B44,B98,C77,C80
`Chr4:36568229`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	12	B107,B126,B61,C22,C28,C30,C35,C46,C56,C67,C76,D4
`Chr4:36568236`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C2,C44
`Chr4:36568374`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B44,C28,C47
`Chr4:36568435`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B44,B98,C80
`Chr4:36568458`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,C21,C29
`Chr4:36568470`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B30,B35,B55,C23
`Chr4:36568506`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B30,B55
`Chr4:36568582`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B30,B35,B55,C23

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

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cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950589.1
AAAATTGGATATTGGGGTCTAGGGTTTTACAACCTCCAAAGAAGACGTATATTGAAAAACGGAGACTGTAAGAAGTTGAAGTGTTGCTGTAGTGCGATCGAATTGAGAGGATGGGAGACAAATTGAGGCTTCATGTAGGAGGATTGGGTTCAAACGTGCAGGTATCCGATCTCGAGAAGACCTTCACCTCACCGCAGTTGGGTGATGTTCAATCCGTCGAGATTATTCGCACGAAAGGTCGCAGCTTTGCTTACTTAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021404
ATGGGAGACAAATTGAGGCTTCATGTAGGAGGATTGGGTTCAAACGTGCAGGTATCCGATCTCGAGAAGACCTTCACCTCACCGCAGTTGGGTGATGTTCAATCCGTCGAGATTATTCGCACGAAAGGTCGCAGCTTTGCTTACTTAGAATTCGTTCCCGCTTCTGATAAAGGCCTCGCCAAGCTCTTCAGCACGTATAATGGGTGCATGTGGAAGGGGGGGAGACTTAAACTTGAGAAGGCCAAAGAAAACTATCAAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806572.1
MGDKLRLHVGGLGSNVQVSDLEKTFTSPQLGDVQSVEIIRTKGRSFAYLEFVPASDKGLAKLFSTYNGCMWKGGRLKLEKAKENYQSRLRREWMEDAQHETKLPSQNVDADESGCAMLKPKKEDLEKMQLKIFFPKLRKLKAIPLKGTGKHKYSFQRIEVPLLPTHFCDCEEHFVPPEPAKRNYSRLPGPAKRNNTVDREVDNYGMNEEELNMMKSILDKLLEKEIRSEIVSSEAEPSEEIQHDASVVDKCQVDDNEEDQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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