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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002264`

染色体: Chr04 坐标: 36635298-36636336 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002264`
名称	SmilChr04G002264
描述	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	36635298 - 36636336 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021407`
GeneID	`131021407`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021407`
原始查询	`LOC131021407`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like
产物	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like
Arabidopsis	`AT3G42170` (DAYSLEEPER) BED zinc finger and hAT dimerization domain-containing protein DAYSLEEPER [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3769417] identity=26.2; qcov=0.818; evalue=3.96e-21; confidence=low
Rice	`Os07g0525300` - identity=33.9; qcov=0.834; evalue=3.17e-41; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF14372 (hAT-like_RNase-H); PF27039 (ZBED1_RNase-like_helical)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021407

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806576.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057806576.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806576.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806576.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806576.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:36635345`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B44,B98,C80
`Chr4:36635374`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B131,B64
`Chr4:36635377`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B30,B35,B55,C23
`Chr4:36635392`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B65,C58
`Chr4:36635405`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C23
`Chr4:36635405`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr4:36635453`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	118	A1,A10,A13,A14,A18,A20,A21,A22,A23,A5,A6,A7,A9,B1,B103,B106,B107,B108,B109,B112,B113,B115,B117,B12,B124,B126,B128,B129,B13,B130,B131,B133,B135,B136,B138,B140,B17,B2,B20,B21,B24,B27,B3,B30,B32,B33,B35,B37,B41,B43,B44,B47,B5,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B58,B60,B61,B62,B63,B67,B71,B73,B74,B81,B85,B89,B95,B96,B97,B98,C1,C11,C14,C20,C21,C23,C27,C29,C31,C32,C34,C35,C36,C37,C40,C41,C43,C45,C46,C49,C51,C52,C54,C55,C57,C58,C59,C63,C67,C69,C70,C72,C78,C79,C8,C80,C85,C87,C9,D3,D4,D9
`Chr4:36635485`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	30	A21,A24,B102,B107,B112,B131,B134,B32,B38,B4,B46,B58,B64,B70,B71,B73,B79,B83,B86,C10,C15,C19,C24,C29,C33,C52,C56,C65,C77,C81
`Chr4:36635491`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B19,B70
`Chr4:36635492`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B6,B70
`Chr4:36635500`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29
`Chr4:36635502`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B122,B69,C8,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806576.1

308 aa

154

308

ZBED1_RNase-like_helical

hAT-like_RNase-H

PF27039 ZBED1_RNase-like_helical 21-143 aa PF14372 hAT-like_RNase-H 164-262 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806576.1`	Pfam	`PF27039`	ZBED1_RNase-like_helical	Domain	21	143	6.5e-30	104.2	ZBED1 RNase-like helical domain
`XP_057806576.1`	Pfam	`PF14372`	hAT-like_RNase-H	Domain	164	262	1.5e-18	67.5	hAT-like transposase, RNase-H fold

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950593.1
ATTAGGTACATGAAGCCAGACTTTGAGAGGTGGGGGACAAGTATTGTTGGTGGCAAGTATTTGCACATGCGTTGTGTTGCTCACATCCTAAACTTAATTGTGAATGAGGGATTAGATGAGATTGGCATGTCCGTGAGACGAGTAAGAGAAGCCGTCAAATGGATAAAGGCATCACCATCTAGAGCGGATAAGTTTAGAGGTTATGTGGAGGCCTTGAAGATTGCTTGCAGCAAGTCTTTGACTTTGGATGTGCCGACGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021407
ATGAAGCCAGACTTTGAGAGGTGGGGGACAAGTATTGTTGGTGGCAAGTATTTGCACATGCGTTGTGTTGCTCACATCCTAAACTTAATTGTGAATGAGGGATTAGATGAGATTGGCATGTCCGTGAGACGAGTAAGAGAAGCCGTCAAATGGATAAAGGCATCACCATCTAGAGCGGATAAGTTTAGAGGTTATGTGGAGGCCTTGAAGATTGCTTGCAGCAAGTCTTTGACTTTGGATGTGCCGACGAGATGGAACTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806576.1
MKPDFERWGTSIVGGKYLHMRCVAHILNLIVNEGLDEIGMSVRRVREAVKWIKASPSRADKFRGYVEALKIACSKSLTLDVPTRWNSTYLMLESAVPYVEVFNLHVNVVKEFVHDLNQKKYKDMTIGVPDSNDWAKVRMICDYLGRFYDLTLLVSGTTYVSAHLFFKEMCSIFEFITQLQRDTDTEIRAMANEMKDKLGKYWLETDEMNPRMNKLFHIAALLDPRQKITHVEKCLKKVYAPQRAIELLGEVRNSLNELFE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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