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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002266`

染色体: Chr04 坐标: 36669915-36674410 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002266`
名称	SmilChr04G002266
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	36669915 - 36674410 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021409`
GeneID	`131021409`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021409`
原始查询	`LOC131021409`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 1-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 1-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=39.2; qcov=0.499; evalue=7.07e-46; confidence=medium
Rice	`Os07g0563600` (OJ1720_F04.111) - identity=39; qcov=0.637; evalue=3.5e-60; confidence=medium
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021409

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806580.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806580.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806580.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806580.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057806580.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:36673656`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	C23,C27,C3,C30,D8
`Chr4:36673656`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	5	C23,C27,C3,C30,D8
`Chr4:36673719`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B26,C11,C69
`Chr4:36673860`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	15	B103,B11,B122,B138,B31,B45,B76,B8,B86,C16,C29,C32,C36,C47,C68
`Chr4:36674010`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806580.1

419 aa

210

419

SWIM

PF04434 SWIM 155-183 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806580.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	155	183	5.1e-08	33.0	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009100940.1
ATCGGATGAGATCCAGTGTACCATAAATTGTGTCCCACTCCATGTCCCATTAATAAAACTACGTAGTTTTAAGTATAACTTTAAAATACATATATTTGCGTCTGAAAATTCGGCTTGGCTTAACGGCTTGGCGAATCTTCTCCATTCACGGATAGATATGCTTCAACTGGATTCGAAGGAAATTTTCCGAATTTCCGGCGAAAATCATCAAGCCATGGAAATCAGATATTCTTTCTCGTCCCAATTCATTCGTTCTCCTA...

XM_057950597.1
ATCGGATGAGATCCAGTGTACCATAAATTGTGTCCCACTCCATGTCCCATTAATAAAACTACGTAGTTTTAAGTATAACTTTAAAATACATATATTTGCGTCTGAAAATTCGGCTTGGCTTAACGGCTTGGCGAATCTTCTCCATTCACGGATAGATATGCTTCAACTGGATTCGAAGGAAATTTTCCGAATTTCCGGCGAAAATCATCAAGCCATGGAAATCAGATATTCTTTCTCGTCCCAATTCATTCGTTCTCCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021409
ATGTTGGATAAGTATGCACTTAAAGAAAATGATTGGTTGAAGCGTTTGTTTAATTTGAAGGAAAAATGGGCTTTAGTCTATGGACGACAAATGTTTTGTGCTGACATGACTACCACCCAAAGGAGTGAGAGTGTGAACAGTGTTGTTAAGAGATATGTAAATTACAAGCACAAGTTTCTAGAATTTTTTAAGCACTTCCAGAGACTTCTTGATGACCGTCGATATGAGGAGATAAAAGCCGATTTTAAAGCAAGTACAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806580.1
MLDKYALKENDWLKRLFNLKEKWALVYGRQMFCADMTTTQRSESVNSVVKRYVNYKHKFLEFFKHFQRLLDDRRYEEIKADFKASTSVPHLTYPVQILKQAAGIYTPEVYKIFEQEWYKAHDCSVECSDDGGLQVSYKITPYNKSHHHIVAFDSSSGKANCSCRKFEFAGILCSHILKVFTMKSITNIPGEYILKRWTRKAKVGFIGDSNLNTCNLDPKMLQNVRYKELCGLYVQLVTKASENEDTYRLVKDGILKMFDI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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