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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002287`

染色体: Chr04 坐标: 37159638-37164103 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002287`
名称	SmilChr04G002287
描述	uncharacterized SmilChr04G002287
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	37159638 - 37164103 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021431`
GeneID	`131021431`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021431`
原始查询	`LOC131021431`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0573000; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os12g0573000; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os12g0573000` - identity=50.6; qcov=0.963; evalue=2.01e-80; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03703 (bPH_2); PF24649 (DUF7642)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021431

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057806600.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	0.40000	`XP_057806600.1`
3	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.20000	`XP_057806600.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057806600.1`
5	Endosome	内体	0.20000	`XP_057806600.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:37160232`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B41,B44,C21,C29
`Chr4:37160653`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C78,D9
`Chr4:37162274`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806600.1

267 aa

134

267

DUF7642

bPH_2

PF24649 DUF7642 95-192 aa PF03703 bPH_2 125-181 aa

XP_057806602.1

267 aa

134

267

DUF7642

bPH_2

PF24649 DUF7642 95-192 aa PF03703 bPH_2 125-181 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806600.1`	Pfam	`PF24649`	DUF7642	Domain	95	192	9.7e-49	164.2	Domain of unknown function (DUF7642)
`XP_057806600.1`	Pfam	`PF03703`	bPH_2	Domain	125	181	4.5e-05	24.4	Bacterial PH domain
`XP_057806602.1`	Pfam	`PF24649`	DUF7642	Domain	95	192	9.7e-49	164.2	Domain of unknown function (DUF7642)
`XP_057806602.1`	Pfam	`PF03703`	bPH_2	Domain	125	181	4.5e-05	24.4	Bacterial PH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950619.1
AGCAAGAATCACATCTCTAAAATATTTGAATCAACGACTTTATTTATCCTCAACATTGTAGATCTTATTACAGACCTAATTTGGCTCGATCCTGTTGACCTTCTTACCTCACACATCCAAAGTTTCCATGAAACACAAGGACGGGTTAGCAGAAATAGACCGGCTGGAAAGGGGCCTGTTACTGGACGGCGGCCCGGATTCCGAGCCGGCCGGCCACGACGAGCAAATCGACGGCGACGAAGACGAGCTGCCGCCCCTTT...

XM_057950617.1
AATTATTAAATAATCAGTCTTACTGAAATTTAAATGTCAAGATATAAACATGATCATGAGACAAACATTTAACAATTGTTACCTATATTTTGGTGTTTTGGTGTATCTTCACTTTAATACAGGACCTTCTTACCTCACACATCCAAAGTTTCCATGAAACACAAGGACGGGTTAGCAGAAATAGACCGGCTGGAAAGGGGCCTGTTACTGGACGGCGGCCCGGATTCCGAGCCGGCCGGCCACGACGAGCAAATCGACGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131021431
ATGAAACACAAGGACGGGTTAGCAGAAATAGACCGGCTGGAAAGGGGCCTGTTACTGGACGGCGGCCCGGATTCCGAGCCGGCCGGCCACGACGAGCAAATCGACGGCGACGAAGACGAGCTGCCGCCCCTTTACACGGCGTCGTTTGGCGAAACCGAAGAAAATTTCGTGAAATACCAGACGACGCGATGGGTTCTGTACTCGCTGCTGTTGATACTGGCGTGGGGCATCGGCTTGTTCATGCTGATTTATCTGCCTCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057806600.1
MKHKDGLAEIDRLERGLLLDGGPDSEPAGHDEQIDGDEDELPPLYTASFGETEENFVKYQTTRWVLYSLLLILAWGIGLFMLIYLPLRRYILRIDIRSRKLYLTSDAIVYKVRRPVSFPCFGVLKKEKHVLLLSVADVAIEQGYLQSLFGVYSIRIENVGVRRPPSDDVQIQGVTDPHAFRKAVLSQLSTMRGEVFSRHVSTLDDNPTPCTGHSSVASMSPSKLRRDSFPHLAEVAILQKLEEVGSSVKRVQTLIEEQKL...

XP_057806602.1
MKHKDGLAEIDRLERGLLLDGGPDSEPAGHDEQIDGDEDELPPLYTASFGETEENFVKYQTTRWVLYSLLLILAWGIGLFMLIYLPLRRYILRIDIRSRKLYLTSDAIVYKVRRPVSFPCFGVLKKEKHVLLLSVADVAIEQGYLQSLFGVYSIRIENVGVRRPPSDDVQIQGVTDPHAFRKAVLSQLSTMRGEVFSRHVSTLDDNPTPCTGHSSVASMSPSKLRRDSFPHLAEVAILQKLEEVGSSVKRVQTLIEEQKL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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