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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002301`

染色体: Chr04 坐标: 37255779-37260849 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002301`
名称	SmilChr04G002301
描述	uncharacterized SmilChr04G002301
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	37255779 - 37260849 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021441`
GeneID	`131021441`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021441`
原始查询	`LOC131021441`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RmlC-like jelly roll fold protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838496]; symbol=AT1G19130; hit=AT1G19130; species=arabidopsis; confidence=high
产物	RmlC-like jelly roll fold protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838496]; symbol=AT1G19130; hit=AT1G19130; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G19130` (AT1G19130) RmlC-like jelly roll fold protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838496] identity=72; qcov=0.731; evalue=5.01e-99; confidence=high
Rice	`Os08g0455800` - identity=59.7; qcov=0.723; evalue=5.68e-76; confidence=high
GO	GO:0005622 (intracellular anatomical structure)
KEGG	-
Pfam	PF06172 (Cupin_5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021441

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	0.80000	`XP_057806610.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057806610.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057806610.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806610.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806610.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:37255818`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	81	A1,A16,A18,A22,A23,A24,A3,A6,A8,B10,B101,B105,B107,B11,B110,B112,B113,B114,B115,B126,B128,B13,B133,B135,B136,B139,B15,B17,B26,B27,B38,B42,B43,B45,B47,B48,B5,B51,B52,B57,B60,B64,B66,B68,B7,B72,B73,B76,B84,B91,B97,B98,B99,C10,C11,C17,C2,C3,C37,C42,C49,C52,C55,C57,C63,C64,C66,C67,C69,C70,C73,C74,C80,C83,C85,C87,C9,D10,D2,D6,D7
`Chr4:37255822`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	82	A1,A16,A18,A22,A23,A24,A3,A6,A8,B10,B101,B105,B107,B11,B110,B112,B113,B114,B115,B126,B128,B13,B133,B135,B136,B139,B15,B17,B26,B27,B38,B42,B43,B45,B47,B48,B5,B51,B52,B57,B60,B64,B66,B68,B7,B72,B73,B76,B84,B91,B97,B98,B99,C10,C11,C17,C2,C29,C3,C37,C42,C49,C52,C55,C57,C63,C64,C66,C67,C69,C70,C73,C74,C80,C83,C85,C87,C9,D10,D2,D6,D7
`Chr4:37255832`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B90,B92,C1,C3,C87
`Chr4:37255832`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B90,B92,C1,C3,C87
`Chr4:37255844`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr4:37255893`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	B100,B118,B134,B23,B31,B36,B64,B94,B97,C30,C4,C43,C7
`Chr4:37255895`	`A`	`ACT`	2bp_insertion	frameshift_variant	12	A25,B112,B131,B49,B52,B6,B73,C57,C63,C71,C75,D3
`Chr4:37255915`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	148	A1,A10,A11,A15,A18,A19,A2,A23,A24,A7,A8,A9,B100,B102,B103,B104,B106,B114,B115,B117,B118,B119,B12,B120,B121,B125,B129,B130,B132,B134,B138,B139,B140,B17,B18,B19,B20,B21,B22,B23,B25,B27,B28,B29,B30,B31,B33,B34,B35,B37,B38,B39,B40,B41,B42,B43,B44,B46,B49,B5,B53,B55,B56,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B65,B66,B67,B68,B69,B70,B71,B75,B76,B77,B78,B79,B85,B86,B87,B9,B93,B95,B96,B98,C1,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C18,C2,C20,C22,C23,C25,C26,C28,C3,C32,C33,C36,C38,C39,C40,C41,C44,C45,C47,C5,C50,C51,C52,C53,C58,C59,C6,C61,C62,C65,C67,C68,C69,C7,C70,C72,C73,C76,C78,C8,C80,C81,C82,C83,C87,D1,D11,D2,D5,D6,D7,D9
`Chr4:37255938`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C23
`Chr4:37255938`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C23
`Chr4:37260029`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr4:37260492`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B54,C35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806610.1

264 aa

132

264

Cupin_5

PF06172 Cupin_5 82-241 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806610.1`	Pfam	`PF06172`	Cupin_5	Domain	82	241	3.7e-43	147.6	Cupin superfamily (DUF985)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950627.1
AAATAAAATAAAATAAGAACAATAAAAAATGAGAACATTATATATAGAAGAGATGGTCTGTAAATCACGTCTGAATCTCTCATCTTTCACAGTCAAACACGCCTCAGGAAAAATCAAACTAATTTTTTTCCCAAACCAAATTGGTTTTTCCTCTCGTCTAAGGAAAACAGAAACCCACCGACAAAGATTTCTCCTTCTCTCTAAATCACAACCATTAACGAGAGCGAGCAACCAGACGAAGAAAATGGGATCAACATCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021441
ATGAGAACATTATATATAGAAGAGATGGTCTGTAAATCACGTCTGAATCTCTCATCTTTCACAGTCAAACACGCCTCAGGAAAAATCAAACTAATTTTTTTCCCAAACCAAATTGGTTTTTCCTCTCGTCTAAGGAAAACAGAAACCCACCGACAAAGATTTCTCCTTCTCTCTAAATCACAACCATTAACGAGAGCGAGCAACCAGACGAAGAAAATGGGATCAACATCACCAAAGAGCTCGCAAGTCATAGCAAAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806610.1
MRTLYIEEMVCKSRLNLSSFTVKHASGKIKLIFFPNQIGFSSRLRKTETHRQRFLLLSKSQPLTRASNQTKKMGSTSPKSSQVIAKLNLKSHQEGGFFSETFRDTSVILSKSHLPPQYKVDRPVSTCIYFLLPSGSVSHLHRIPCAETWHFYLGEPLTVVELNDNDGSIKFTCLGPDPLAENQVVQHTVPPNVWFGAFPTKDIDISSDATVKRATRDHEAHFSLVGCTCAPAFQFDDFELAKRSELVSHFPKYESLITML...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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