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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002303`

染色体: Chr04 坐标: 37296982-37302644 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002303`
名称	SmilChr04G002303
描述	protein LAZ1 homolog 2
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	37296982 - 37302644 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021443`
GeneID	`131021443`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021443`
原始查询	`LOC131021443`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein LAZ1 homolog 2
产物	protein LAZ1 homolog 2
Arabidopsis	`AT1G23070` (AT1G23070) organic solute transporter ostalpha protein (DUF300) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838915] identity=66.2; qcov=0.917; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0406900` (OSJNBa0002D18.12) - identity=59.3; qcov=0.915; evalue=5.08e-170; confidence=high
GO	GO:0005215 (transporter activity); GO:0006810 (transport)
KEGG	-
Pfam	PF03619 (Solute_trans_a)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021443

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057806612.1`
2	Endosome	内体	0.60000	`XP_057806612.1`
3	Endosome membrane	内体膜	0.40000	`XP_057806612.1`
4	Vesicle	囊泡	0.20000	`XP_057806612.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806612.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:37301752`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B98,C2,C44,C80
`Chr4:37302194`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr4:37302315`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B76,C21,C29,C49
`Chr4:37302316`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806612.1

422 aa

211

422

Solute_trans_a

PF03619 Solute_trans_a 29-304 aa

XP_057806613.1

422 aa

211

422

Solute_trans_a

PF03619 Solute_trans_a 29-304 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806612.1`	Pfam	`PF03619`	Solute_trans_a	Family	29	304	1.7e-89	300.4	Organic solute transporter Ostalpha
`XP_057806613.1`	Pfam	`PF03619`	Solute_trans_a	Family	29	304	1.7e-89	300.4	Organic solute transporter Ostalpha

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950630.1
TAAACACACACACTCACAAAACACACACACACACACACCACGCAAACCACAAGCGCCGCACCCTCTCTCTCGTCTGCACTCTCCGGTCGATGGCGGCAGCGTCGCCGCTGCGCCATGACAGCGTCTCCTCCCCTTCTCGCATCACTCTCCGTCTTCCTCTCTTTCACCCTCTGTCGCCGCTGTCTTCATGTCGCCGCCAGCCTCCATCCTCGCCGCCTCCACCTCGCCAGAAATTATGGCTCTTTCATCTTTCGTCGCCA...

XM_057950629.1
TTCTTAATCTCCGTGCCGAAAAGAATGTGGTCAACAATATGTGGCCAACAATATTGAGACGGATGGAGTAATATTTATTGGTTCGGTTCGGTTTAAAACCGAAACTGGACCGAAACTTATCGGTTTTTAATTTTCGGAACCGAACGAAAATCGAACCAGTGGAATCGGGACCGAACCGCACCGAAACGGTTCGGTTCGATTCAATTTTGCATTTCAGTTCGGTTTCTGCTCACCCCTACATTATCAAGAGAAAAATAGAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131021443
ATGGAATCCTATTTGTTTCTGTATCGAAACATTTATAAAGATCTTCACTGGCCAAACATTTATAAAGATCTTCATTGGCCAGCCCTTAGCATTGCAGGGTGCTTCGTTTTTGTAGCATTAGTTCTTTCACTTCTCCTCACTTTCCAGCATCTCCGATGGTACACCAGACCTTCGGAGCAAAAGTGGATTGTTTCTGTTATCTTTATTGTCCCGGTGTATGCAACTGAATCAATTCTGTCCTTGTGGAATGCACACTTGTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057806612.1
MESYLFLYRNIYKDLHWPNIYKDLHWPALSIAGCFVFVALVLSLLLTFQHLRWYTRPSEQKWIVSVIFIVPVYATESILSLWNAHLSLACDILRNCYEAFALYAFGSYLVACLGGELQVMEFLDEEAKKQISKPLLEGEKSSQQQGKRFCNFFFHPCLVGRELFSIIKFGLVQYMIMKTVCALLALVLELCGVYGDGEFKWHYGYPYITIVLNFSQMWALYCLVQFYNVTHRKLQPIKPLAKFISFKAIVFATWWQGVGI...

XP_057806613.1
MESYLFLYRNIYKDLHWPNIYKDLHWPALSIAGCFVFVALVLSLLLTFQHLRWYTRPSEQKWIVSVIFIVPVYATESILSLWNAHLSLACDILRNCYEAFALYAFGSYLVACLGGELQVMEFLDEEAKKQISKPLLEGEKSSQQQGKRFCNFFFHPCLVGRELFSIIKFGLVQYMIMKTVCALLALVLELCGVYGDGEFKWHYGYPYITIVLNFSQMWALYCLVQFYNVTHRKLQPIKPLAKFISFKAIVFATWWQGVGI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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