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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002309`

染色体: Chr04 坐标: 37390072-37392402 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002309`
名称	SmilChr04G002309
描述	serine/threonine-protein kinase RIPK-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	37390072 - 37392402 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021450`
GeneID	`131021450`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021450`
原始查询	`LOC131021450`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/threonine-protein kinase RIPK-like
产物	serine/threonine-protein kinase RIPK-like
Arabidopsis	`AT2G05940` (RIPK) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815147] identity=71.3; qcov=0.997; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0179400` (RLCK103) - identity=69.4; qcov=0.901; evalue=9.75e-170; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021450

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057806622.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057806622.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806622.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806622.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806622.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:37390376`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C2,C44
`Chr4:37390598`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B40,B78,C77
`Chr4:37390913`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B66,B71,B93
`Chr4:37390925`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B23,B31,C43
`Chr4:37391969`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806622.1

384 aa

192

384

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 77-348 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 78-351 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806622.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	77	348	8.1e-44	150.7	Protein kinase domain
`XP_057806622.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	78	351	2.7e-48	165.3	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950639.1
CATTCATGTAATTCCTCACCATATATCTTATAAAACCATCTGCAAACCTTATACCTCCATGTCTAGAGAGAGAGGGAAGACGTGAATAACTTCATTCTTCATTCTCAATAAAATTAAAATCAATATATGGCAGTGAAGAAGAAGGCGGCGAGGTGGCAGGACTTGATTCCGGTGTGTTTCAAGGTGAAGGCGGCGGAGAAGAAAGCGGCGGCGAAGCAGCAGTCGTCAAGGATTTCATTATTGGACTTGAGCAGCTCGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021450
ATGGCAGTGAAGAAGAAGGCGGCGAGGTGGCAGGACTTGATTCCGGTGTGTTTCAAGGTGAAGGCGGCGGAGAAGAAAGCGGCGGCGAAGCAGCAGTCGTCAAGGATTTCATTATTGGACTTGAGCAGCTCGACGCTTTCGGAGGAGCTCTCCGTGTCGCTGGCGGCGTCAAATCTCCACGTTTTCACGCTTCAGGAACTCAAGCTCATCACTCACAACTTCGCGTCCACCAATTTTCTCGGCCAAGGCGGCTTCGGCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806622.1
MAVKKKAARWQDLIPVCFKVKAAEKKAAAKQQSSRISLLDLSSSTLSEELSVSLAASNLHVFTLQELKLITHNFASTNFLGQGGFGPVHKGFIDDTLRPGLKAQPVAVKLLDLDGTQGHREWLTEVVFLGQLRHANLVKLIGYCCEEAQRLLVYEYMPRGSLENQLFRKMCIPLPWSTRMKIALGAAKGLAFLHEANKPVIYRDFKASNILLDSDFTAKLADLGLAKDGPQGDETHISTRVMGTQGYTAPEYIMTGHLTS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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