Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002310`

染色体: Chr04 坐标: 37405791-37411721 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002310`
名称	SmilChr04G002310
描述	uncharacterized SmilChr04G002310
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	37405791 - 37411721 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021451`
GeneID	`131021451`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021451`
原始查询	`LOC131021451`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OBP3-responsive protein 4 (ORG4) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815155]; symbol=ORG4; hit=AT2G06010; species=arabidopsis; confidence=high
产物	OBP3-responsive protein 4 (ORG4) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815155]; symbol=ORG4; hit=AT2G06010; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G06010` (ORG4) OBP3-responsive protein 4 (ORG4) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815155] identity=76.3; qcov=0.925; evalue=3.21e-103; confidence=high
Rice	`Os04g0446200` - identity=63.9; qcov=0.444; evalue=2.54e-34; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF25003 (DUF7781)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021451

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057806623.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.80000	`XP_057806623.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057806623.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806623.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806623.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变，或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806623.1

187 aa

187

DUF7781

PF25003 DUF7781 11-183 aa

XP_057806624.1

187 aa

187

DUF7781

PF25003 DUF7781 11-183 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806623.1`	Pfam	`PF25003`	DUF7781	Domain	11	183	1.6e-89	298.7	Domain of unknown function (DUF7781)
`XP_057806624.1`	Pfam	`PF25003`	DUF7781	Domain	11	183	1.6e-89	298.7	Domain of unknown function (DUF7781)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950641.1
AATAACAGAAGAAAATAAAATTATTTGTTTGGGGTGGGGGTAAAAGTGCTTCGTGACAGTTGAAGATAGAAAACCCTGAACTCAGAAGCAAGGACTGAAAGAGTGCAGGCGGTTGCTGCTCATTACCCTTTCCCTGCAACCCTTACCGAGAGCAGCAATTTCAATTTCTTTCGAACAACCAGAAAGGATATGGAAGGCACATCGAACGGAGATGAACCCAAATCGTGGGACGAGCTTTACAACTTCAATTTGATGCCTAC...

XM_057950640.1
AATAAAATTATTTGTTTGGGGTGGGGGTAAAAGTGCTTCGTGACAGTTGAAGATAGAAAACCCTGAACTCAGAAGCAAGGACTGAAAGAGTGCAGGCGGTTGCTGCTCATTACCCTTTCCCTGCAACCCTTACCGAGAGCAGCAATTTCAATTTCTTTCGAACAACCAGAAAGGATATGGAAGGCACATCGAACGGAGATGAACCCAAATCGTGGGACGAGCTTTACAACTTCAATTTGATGCCTACGGAGATTTTCTTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131021451
ATGGAAGGCACATCGAACGGAGATGAACCCAAATCGTGGGACGAGCTTTACAACTTCAATTTGATGCCTACGGAGATTTTCTTGAAGTTCAGGAAAGAGATTCAGGGGTTCCGCGTTGGCGTTAATTTAGAGTTGTATAATGCTCCCCTGAATGACTACCATGCGAAACTGGTTTTGAAACCTTTAGCGTTTGAGCGGAAATGGAAGTTAATGTATGAGCCTTTATACCAAGATGTGCAGCTTGTTTCCAAGAAAATTCC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057806623.1
MEGTSNGDEPKSWDELYNFNLMPTEIFLKFRKEIQGFRVGVNLELYNAPLNDYHAKLVLKPLAFERKWKLMYEPLYQDVQLVSKKIPITKFLNLQVGVGHSFQLHATGWKWKLTTSLGGDGISRIRNKTSLGLCPGVDFRFGWRADYVLPEITGGVGSDEPLFNMNSGRLQASLDRVEAIFTHTDEE

XP_057806624.1
MEGTSNGDEPKSWDELYNFNLMPTEIFLKFRKEIQGFRVGVNLELYNAPLNDYHAKLVLKPLAFERKWKLMYEPLYQDVQLVSKKIPITKFLNLQVGVGHSFQLHATGWKWKLTTSLGGDGISRIRNKTSLGLCPGVDFRFGWRADYVLPEITGGVGSDEPLFNMNSGRLQASLDRVEAIFTHTDEE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器