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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002324`

染色体: Chr04 坐标: 37552300-37556421 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002324`
名称	SmilChr04G002324
描述	RING-box protein 1a
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	37552300 - 37556421 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021462`
GeneID	`131021462`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021462`
原始查询	`LOC131021462`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RING-box protein 1a
产物	RING-box protein 1a
Arabidopsis	`AT5G20570` (RBX1) RING-box 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832179] identity=83.7; qcov=1; evalue=1.58e-71; confidence=high
Rice	`Os01g0106800` (OsRBX1b) - identity=75.4; qcov=1.02; evalue=6.46e-65; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0006511 (ubiquitin-dependent protein catabolic process); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0016567 (protein ubiquitination); GO:0031461 (cullin-RING ubiquitin ligase complex); GO:0061630 (ubiquitin protein ligase activity); GO:0097602 (cullin family protein binding)
KEGG	smil03420 (Nucleotide excision repair - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04120 (Ubiquitin mediated proteolysis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF12678 (zf-rbx1); PF12861 (zf-ANAPC11)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021462

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806638.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057806638.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057806638.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057806638.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806638.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变，或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806638.1

123 aa

123

zf-rbx1

zf-ANAPC11

PF12678 zf-rbx1 55-113 aa PF12861 zf-ANAPC11 55-119 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806638.1`	Pfam	`PF12678`	zf-rbx1	Domain	55	113	1.8e-25	89.6	RING-H2 zinc finger domain
`XP_057806638.1`	Pfam	`PF12861`	zf-ANAPC11	Domain	55	119	9.2e-13	48.8	Anaphase-promoting complex subunit 11 RING-H2 finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950655.1
CGAAATTTTCGTTCGTTCAACTCGTGTAGCTTCTTGTCGACAGTGGTTTCTCTTCAACTTTTCGTCAACTTCTCCTCTCGTCAACAAGTTCTCGCCTTCTTCTCGGTCTTCTCGGAGTTAAAATTGCCTCCACAGTAGCAGTCAACAATGGTGAAAGTTGTTTTACAGCAAGAATTATAAGGGATTAGGTTAAATTCGTGATTTTTTACCTGCCAGCCACAAAACAACGTAGTTTAGGTAGTTTAAATTATAAAACGACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021462
ATGGCCTCACTTGATACCGACGTCAATATGGTTCCCGCCGGCGATGGATCCTCCGGCGCCGGGCCCTCCACCATCAATCCCTCATCGTCCACCAAGAAACCCAAGCGATTCGAGATTAAAAAGTGGAACGCCGTCTCCCTCTGGGCTTGGGATATCGTGGTCGACAATTGTGCTATTTGCAGAAATCATATCATGGATCTATGCATCGAGTGTCAGGCTAATCAGGCCAGCGCAACAAGCGAGGAATGCACAGTTGCATG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806638.1
MASLDTDVNMVPAGDGSSGAGPSTINPSSSTKKPKRFEIKKWNAVSLWAWDIVVDNCAICRNHIMDLCIECQANQASATSEECTVAWGVCNHAFHFHCISRWLKTRQVCPLDNSEWEFQKYGH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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