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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002335`

染色体: Chr04 坐标: 37688375-37691869 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002335`
名称	SmilChr04G002335
描述	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g37250
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	37688375 - 37691869 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021471`
GeneID	`131021471`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021471`
原始查询	`LOC131021471`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g37250
产物	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At4g37250
Arabidopsis	`AT4G37250` (AT4G37250) Leucine-rich repeat protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829879] identity=54.7; qcov=0.978; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0110100` - identity=47.5; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00560 (LRR_1); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF08263 (LRRNT_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021471

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057806651.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806651.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806651.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806651.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806651.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:37688704`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B16,B37,B9,C58
`Chr4:37688986`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr4:37689020`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr4:37689064`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr4:37689094`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C67
`Chr4:37689355`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,B8
`Chr4:37689467`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C13,C16,C68
`Chr4:37689484`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B12
`Chr4:37689484`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B12
`Chr4:37689671`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B129,B89,C26
`Chr4:37689681`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B87,C78,D9
`Chr4:37689860`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B16,B21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806651.1

767 aa

384

767

LRRNT_2

LRR_1

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF08263 LRRNT_2 27-67 aa PF00560 LRR_1 102-122 aa PF00560 LRR_1 127-148 aa PF00560 LRR_1 195-215 aa PF00560 LRR_1 218-238 aa PF00069 Pkinase 463-756 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 479-606 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806651.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	27	67	1.2e-13	51.8	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057806651.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	102	122	3.9e-16	56.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057806651.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	127	148	3.9e-16	56.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057806651.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	195	215	3.9e-16	56.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057806651.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	218	238	3.9e-16	56.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057806651.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	463	756	5.1e-26	92.4	Protein kinase domain
`XP_057806651.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	479	606	3.5e-25	89.5	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950668.1
GCATCATTGTGTGTCGTACTTTGTCCTTAATAATTTTTTCAATCATGGATGTCTCATTACAGAGTATTTTGGTTTTCGGTTAGCAAAGTTTTGGTGAAACCATTATTGTCCGATCCTTGTGAATATTTATTGTTTTTGCACCGCGCACCACATGGTCCCTTGTGCCTCATCATAAATCTCACTTAATTCATTTTCTCTCTCATCTCTCTCTCTCCCCCTCTTCTGTTTGCGAGAAACCGATATGTGGGATCGCTGCAAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021471
ATGAGAGCCCGAAACTTGGATCTGCTGAATGTATGGGCCCTCGCATTGGCCCTCCTTATTCGGGCCGGATCGTTCGGGCTCAACACTGACGGCGTGCTCTTGCTGTCGTTCAAATACAGCATCACAGCCGATCCATTCCAAGCTCTGCGGAGCTGGAACGCCAACGACGACACGCCGTGCTCGTGGAACGGCGTCACCTGCGGAGCTCCGGGCTCCGGCGAGGCCTATTTCCGTGTTACGGGCCTATCCCTCCCCGATTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806651.1
MRARNLDLLNVWALALALLIRAGSFGLNTDGVLLLSFKYSITADPFQALRSWNANDDTPCSWNGVTCGAPGSGEAYFRVTGLSLPDSGLRGSLPATLGMIDHLQNINLSNNSINGSIPSTLFSVSELEFFDLSSNFLSGTLPEPLGELRNLRLLNLSDNALVGKLPLNQTATPNLTAVSLKNNYFFGPIPGKIESIQVLDLSSNLINGSLPPDLGGPSLSYLNVSYNRLSGNIPPEFATQIPPNATVDLSHNNLSGPVPA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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