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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002344`

染色体: Chr04 坐标: 37802850-37807900 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002344`
名称	SmilChr04G002344
描述	uncharacterized SmilChr04G002344
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	37802850 - 37807900 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021482`
GeneID	`131021482`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021482`
原始查询	`LOC131021482`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818824]; symbol=AT2G42240; hit=AT2G42240; species=arabidopsis; confidence=high
产物	RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818824]; symbol=AT2G42240; hit=AT2G42240; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G42240` (AT2G42240) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818824] identity=57.4; qcov=0.997; evalue=1.41e-107; confidence=high
Rice	`Os06g0151200` - identity=39.5; qcov=1; evalue=1.72e-50; confidence=medium
GO	GO:0003729 (mRNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021482

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806663.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057806663.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806663.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806663.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806663.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:37803213`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr4:37803971`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,C72
`Chr4:37803981`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,C38,C75,C86
`Chr4:37804014`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	174	A10,A11,A13,A14,A15,A18,A2,A20,A21,A23,A24,A25,A4,A5,A6,B1,B10,B102,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B11,B113,B114,B117,B118,B12,B120,B121,B122,B124,B125,B126,B127,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B2,B21,B22,B24,B25,B28,B3,B31,B32,B33,B35,B37,B4,B40,B41,B46,B47,B48,B5,B50,B51,B53,B54,B55,B58,B59,B61,B62,B63,B67,B68,B69,B7,B72,B73,B74,B75,B78,B8,B80,B81,B82,B83,B86,B90,B92,B94,B95,C1,C10,C11,C12,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C25,C27,C29,C3,C31,C32,C33,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C43,C45,C47,C48,C5,C50,C51,C54,C55,C57,C58,C59,C60,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C68,C69,C7,C70,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C80,C81,C82,C84,C85,C86,C87,D1,D10,D11,D6,D7,D8,D9
`Chr4:37805238`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B58,B66
`Chr4:37806156`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C16,C62,D3
`Chr4:37807007`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B87,C78,D9
`Chr4:37807502`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B29
`Chr4:37807606`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	43	A16,A3,B10,B103,B110,B112,B113,B126,B128,B13,B136,B139,B15,B17,B26,B42,B43,B5,B51,B52,B57,B64,B66,B68,B75,B84,C1,C10,C17,C22,C27,C40,C42,C49,C55,C67,C70,C73,C74,C83,C9,D2,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806663.1

324 aa

162

324

RRM_1

PF00076 RRM_1 61-125 aa PF00076 RRM_1 221-283 aa

XP_057806664.1

323 aa

162

323

RRM_1

PF00076 RRM_1 61-125 aa PF00076 RRM_1 220-282 aa

XP_057806665.1

307 aa

154

307

RRM_1

PF00076 RRM_1 61-125 aa PF00076 RRM_1 221-283 aa

XP_057806666.1

306 aa

153

306

RRM_1

PF00076 RRM_1 61-125 aa PF00076 RRM_1 220-282 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806663.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	61	125	1.6e-21	76.7	RNA recognition motif
`XP_057806663.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	221	283	1.6e-21	76.7	RNA recognition motif
`XP_057806664.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	61	125	1.6e-21	76.7	RNA recognition motif
`XP_057806664.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	220	282	1.6e-21	76.7	RNA recognition motif
`XP_057806665.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	61	125	1.3e-21	76.9	RNA recognition motif
`XP_057806665.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	221	283	1.3e-21	76.9	RNA recognition motif
`XP_057806666.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	61	125	1.3e-21	76.9	RNA recognition motif
`XP_057806666.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	220	282	1.3e-21	76.9	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950683.1
TTTGTTGTTTACTCCAAAATAAAAAAAATGAAGAAAAATGATTTATTAGTTGTAATAAGCAATAAGCAGAAGAACTAAAAGGTGCTTTTCCTTCTCCGTTGAGGTGGTGGTGCCCTAGAGCTCGTCGGCAGTCCGAATCATAGCTTTAATGGACGATCTCACTGCTTATTACGCTCCTCCAATCCACCACCCTTACTACCAGCCGCCTCCTCCTCCGCCTCCGGGAACGGCGCATACGCCCCCGGCCGCCGTCGCCCACG...

XM_057950682.1
AAAAAAAATGAAGAAAAATGATTTATTAGTTGTAATAAGCAATAAGCAGAAGAACTAAAAGGTGCTTTTCCTTCTCCGTTGAGGTGGTGGTGCCCTAGAGCTCGTCGGCAGTCCGAATCATAGCTTTAATGGACGATCTCACTGCTTATTACGCTCCTCCAATCCACCACCCTTACTACCAGCCGCCTCCTCCTCCGCCTCCGGGAACGGCGCATACGCCCCCGGCCGCCGTCGCCCACGTCCAGCCCCAAATCGTCGCC...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131021482
ATGGACGATCTCACTGCTTATTACGCTCCTCCAATCCACCACCCTTACTACCAGCCGCCTCCTCCTCCGCCTCCGGGAACGGCGCATACGCCCCCGGCCGCCGTCGCCCACGTCCAGCCCCAAATCGTCGCCTACGCTCCTCCAATCTACCCACAGTCTTCGCACGACCAGGTTCGTACGCTCTTTGTCGCCGGCCTCCCCGACGACGTCAAGCCGCGAGAACTCTACAATCTCTTCCGAGAATGCCCCGGATACCAGTC...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057806663.1
MDDLTAYYAPPIHHPYYQPPPPPPPGTAHTPPAAVAHVQPQIVAYAPPIYPQSSHDQVRTLFVAGLPDDVKPRELYNLFRECPGYQSSNLRPPTSSNNQPFAFATFVDQQSAVMALHAFNGMVFDLEKGSTLYIDLAKSNSRSKRLRADDESQGSEKRLKGAVASSRGDDPAGLGSIHTPGMGNSAYNTIGYSSTQSLRNVDGGSMSGASLKSNSSPCPTLFVANLGPHCTEDELTQLFSRCRGFIKLKMQSTYGAPVAF...

XP_057806664.1
MDDLTAYYAPPIHHPYYQPPPPPPPGTAHTPPAAVAHVQPQIVAYAPPIYPQSSHDQVRTLFVAGLPDDVKPRELYNLFRECPGYQSSNLRPPTSSNNQPFAFATFVDQQSAVMALHAFNGMVFDLEKGSTLYIDLAKSNSRSKRLRADDESQGSEKRLKGAVASSRGDDPGLGSIHTPGMGNSAYNTIGYSSTQSLRNVDGGSMSGASLKSNSSPCPTLFVANLGPHCTEDELTQLFSRCRGFIKLKMQSTYGAPVAFV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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