当前解析结果
SmilChr04G002369| 统一新 Gene ID | SmilChr04G002369 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G002369 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G002369 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 38182282 - 38185735 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131021502 |
|---|---|
| GeneID | 131021502 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131021502 |
| 原始查询 | LOC131021502 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | receptor-interacting protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825893]; symbol=AT4G21445; hit=AT4G21445; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | receptor-interacting protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825893]; symbol=AT4G21445; hit=AT4G21445; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT4G21445 (AT4G21445)receptor-interacting protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825893] identity=60.5; qcov=0.956; evalue=1.13e-45; confidence=medium |
| Rice | Os04g0635700- identity=82.9; qcov=0.607; evalue=1.18e-42; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF30503 (CRR9) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131021502 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057806699.1 |
| 2 | Chloroplast stroma | 叶绿体基质 | 0.60000 | XP_057806699.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057806699.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057806699.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057806699.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:38182413 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B109 |
Chr4:38182528 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C77 |
Chr4:38182537 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B131,B41 |
Chr4:38182645 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C43,C8 |
Chr4:38182722 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B18,B59,C10,C6,C81 |
Chr4:38182731 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B44 |
Chr4:38182768 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C50 |
Chr4:38182792 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C77 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057806699.1PF30503
CRR9 57-116 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057806699.1 |
Pfam | PF30503 |
CRR9 | Domain | 57 | 116 | 1e-12 | 49.1 | NDH complex assembly factor CRR9 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。