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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002374`

染色体: Chr04 坐标: 38245277-38252814 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002374`
名称	SmilChr04G002374
描述	protein unc-13 homolog
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	38245277 - 38252814 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021505`
GeneID	`131021505`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021505`
原始查询	`LOC131021505`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein unc-13 homolog
产物	protein unc-13 homolog
Arabidopsis	`AT2G25800` (AT2G25800) elongation factor Ts (DUF810) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817122] identity=55.5; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0346700` (P0512H04.9-1) - identity=53.2; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF25761 (TPR_PATROL1); PF27629 (UNC13_3rd)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021505

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057806702.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057806702.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057806702.1`
4	Clathrin-coated vesicle	Clathrin-coated vesicle	0.20000	`XP_057806702.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806702.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:38245597`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr4:38245821`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C59,C84
`Chr4:38245965`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B47,B53
`Chr4:38245974`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr4:38245987`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,C24,C77
`Chr4:38246024`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B83,C23,C59
`Chr4:38246049`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B79,C50
`Chr4:38246053`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B139,C18,C22
`Chr4:38246157`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr4:38246287`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr4:38246535`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr4:38246646`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B125,B81,C41,C6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806702.1

937 aa

468

937

UNC13_3rd

TPR_PATROL1

PF27629 UNC13_3rd 283-383 aa PF25761 TPR_PATROL1 539-936 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806702.1`	Pfam	`PF27629`	UNC13_3rd	Domain	283	383	5.4e-18	66.0	UNC13 third domain
`XP_057806702.1`	Pfam	`PF25761`	TPR_PATROL1	Repeat	539	936	7.8e-155	516.5	PATROL1-like, TPR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950719.1
GCTCTTTTTCAACCCTTGTCTTCCATTAATCAATTGCATTTATCGTCATCCCGAGTTGGCTGTCCAGTCAGTCTCCACCTCCGTCTAAACAATTGAATTTCAAAAAATATATTCATTCCTTAAAAGTCAAGCAAGACTATAACCCACCACCTCCCTCCCTTTTCGACCCTTTCCATTCCTTCCTTCAATTTTCCTGAATTCCATGCAATAATGATTCACAATTCAGGGATGGACCCGTTTGGCGAGCTGGGTGTGGACCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021505
ATGATTCACAATTCAGGGATGGACCCGTTTGGCGAGCTGGGTGTGGACCTTTCTTCGTCGGAGCTCCGGGAAACCGCTTACGAAATCCTCGTCGGAGCATGCCGGAGCTCCGGCTCCGGGAGGCGCCTCACTTACGTTTCGAGTTCGAATTTGAAGGAGAGAAGTCAGCAGCAGTCGCAGACGCACAAGTCAGCTGCGAGCAAGGTGAAGAAGGCTCTGGGCCTCAAGCCCAAGAAGAAGAAGAAGAGCAGCGGCGAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806702.1
MIHNSGMDPFGELGVDLSSSELRETAYEILVGACRSSGSGRRLTYVSSSNLKERSQQQSQTHKSAASKVKKALGLKPKKKKKSSGEEEDEPDRKSLGELMRVQMRVPEQTDSRIRRGFLRVAAGQLGRRIESMVLPLELLQHFRSSDFSSEREYEAWQRRNLKILEAGLLIHPHVPLDKSLTAPQRLRHILHAASEKPIDTDKHSESMLVLCNVVTSLACRSFDGSTSDICHWADGIPLNLHLYKILIEACFDVNDEASV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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