当前解析结果
SmilChr04G002377| 统一新 Gene ID | SmilChr04G002377 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G002377 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G002377 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 38281427 - 38291693 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131021510 |
|---|---|
| GeneID | 131021510 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131021510 |
| 原始查询 | LOC131021510 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | OsEnS-79; symbol=OsEnS-79; hit=Os05g0557900; species=rice; confidence=high |
| 产物 | OsEnS-79; symbol=OsEnS-79; hit=Os05g0557900; species=rice; confidence=high |
| Arabidopsis | AT2G44970 (AT2G44970)alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819105] identity=65; qcov=0.706; evalue=4.94e-163; confidence=high |
| Rice | Os05g0557900 (OsEnS-79)- identity=68.4; qcov=0.731; evalue=7.02e-175; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131021510 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast membrane | 叶绿体膜 | 0.80000 | XP_057806715.1 |
| 2 | Chloroplast | 叶绿体 | 0.60000 | XP_057806715.1 |
| 3 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.40000 | XP_057806718.1 |
| 4 | Nucleus membrane | 核膜 | 0.20000 | XP_057806715.1 |
| 5 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.20000 | XP_057806718.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:38281720 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C29,D10 |
Chr4:38284878 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C8 |
Chr4:38285081 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D3 |
Chr4:38285585 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C52 |
Chr4:38288321 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C8 |
Chr4:38288557 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C8 |
Chr4:38288716 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C50 |
Chr4:38288984 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C10,D4 |
Chr4:38289028 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B100,B125,B81,C41,C6 |
Chr4:38289036 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B109 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
5 records
下载 cDNA FASTA5 records
下载 CDS FASTA5 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。