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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001880`

染色体: Chr01 坐标: 33820325-33823164 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001880`
名称	SmilChr01G001880
描述	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	33820325 - 33823164 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021512`
GeneID	`131021512`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021512`
原始查询	`LOC131021512`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
产物	putative late blight resistance protein homolog R1C-3
Arabidopsis	`AT3G46530` (RPP13) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823806] identity=32.2; qcov=0.771; evalue=1.19e-68; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=34.4; qcov=0.816; evalue=2.24e-83; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021512

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057806725.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057806725.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806725.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806725.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806725.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:33820601`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	A24,B84,C30
`Chr1:33820601`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	3	A24,B84,C30
`Chr1:33820633`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B77,D7
`Chr1:33820670`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B84,C30
`Chr1:33820722`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:33820735`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:33821059`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B24,B50,C21,C52
`Chr1:33821140`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:33821147`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,B55
`Chr1:33821186`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:33821190`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	C34,C54,C7,C9
`Chr1:33821190`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	CDS_variant	4	C34,C54,C7,C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806725.1

850 aa

425

850

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 150-312 aa PF23559 WHD_DRP 395-465 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806725.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	150	312	5e-41	140.9	NB-ARC domain
`XP_057806725.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	395	465	4.5e-21	75.4	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950742.1
ATATATCAGAGGTTAAAGATGGCGGCTTATGCATCTCTAGTTTCTTTGTTGAATACTATGGAGAAGATCCAGGCTCATCCTCTCCTCTCTACTTGTTTGGACAAGTACCAGAATGAATCTCTTCGCACAAAGGTTGATTTCTTTCTAGATTTTGTAGAGCATTATTCAGATGCAGGCAGCAGAGAAGCAGATGATTTGCTGAGGCGAATTGCATTCGTGGCTCATGCGGCTGAAGATATAACTGAATGTGAAGCAGCAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021512
ATGGCGGCTTATGCATCTCTAGTTTCTTTGTTGAATACTATGGAGAAGATCCAGGCTCATCCTCTCCTCTCTACTTGTTTGGACAAGTACCAGAATGAATCTCTTCGCACAAAGGTTGATTTCTTTCTAGATTTTGTAGAGCATTATTCAGATGCAGGCAGCAGAGAAGCAGATGATTTGCTGAGGCGAATTGCATTCGTGGCTCATGCGGCTGAAGATATAACTGAATGTGAAGCAGCAGATCGAGTTCGTGCTGTTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806725.1
MAAYASLVSLLNTMEKIQAHPLLSTCLDKYQNESLRTKVDFFLDFVEHYSDAGSREADDLLRRIAFVAHAAEDITECEAADRVRAVSTKKSLQMLLRLQRIIDGMFSIEEKVIKFKEEMGCINRQPSYSTSSAASVKTAAMVGFDGYLVQLLDQLTGQPPERRIISIVGMGGIGKTTLARNVYENLLTVQHFDVRAWVTVSQDYNAREILKEALSCLGGLSSNIDKDQLGEELHKTLYGRRYLIILDDVWSVEVWDRMNF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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