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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001881`

染色体: Chr01 坐标: 33824109-33826573 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001881`
名称	SmilChr01G001881
描述	NAC domain-containing protein 40-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	33824109 - 33826573 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021522`
GeneID	`131021522`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021522`
原始查询	`LOC131021522`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NAC domain-containing protein 40-like
产物	NAC domain-containing protein 40-like
Arabidopsis	`AT2G27300` (NTL8) NTM1-like 8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817273] identity=52.7; qcov=0.755; evalue=7.93e-84; confidence=high
Rice	`Os01g0261200` (OsNAC8) - identity=57.2; qcov=0.448; evalue=1.01e-56; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF02365 (NAM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021522

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806734.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806734.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806734.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806734.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057806734.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:33825375`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:33825448`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,B71,C54,C56
`Chr1:33826023`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B94,C50,C64,C70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806734.1

354 aa

177

354

NAM

PF02365 NAM 28-151 aa

XP_057806740.1

348 aa

174

348

NAM

PF02365 NAM 28-151 aa

XP_057806749.1

339 aa

170

339

NAM

PF02365 NAM 13-136 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806734.1`	Pfam	`PF02365`	NAM	Family	28	151	5.3e-47	160.0	No apical meristem (NAM) protein
`XP_057806740.1`	Pfam	`PF02365`	NAM	Family	28	151	5.1e-47	160.1	No apical meristem (NAM) protein
`XP_057806749.1`	Pfam	`PF02365`	NAM	Family	13	136	4.8e-47	160.2	No apical meristem (NAM) protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950766.1
ATAAAAAATGGTAGATGAAATGTGGAAGTTATTATCGAATTGGAGGCAGATATGTGCGGCGGAAGAGATGAGGGCTGAATCCAGTAGGCGACAGGTGATCTGAGCTGAGGTGGAGCAGTTGCATGCGAAACAAGTAGAGCTCAGAAGCCACGCCCACGTGGGCTCACGTGAACTTCACGCTCCACTCGTCTCTCTCAACAAACAAGAAGAAAAGCAACTTGTTTGGGTGTATCAGCATCGGCGACAACGACAGATCAATT...

XM_057950751.1
ATCAGCATCGGGTTCGTTCCTTGCCCCTATTCTAAGTTCTAACATATTCCAAAACAGGGGATTTTCCCTTCTTTAATTACAATTAAAATAAAATAATGGGCAGCTGTAATATCAGCGACAACGACAGATCAATTTGTTCCATGGAAATCTCCATAGCCGAAGCTTCTTCCATGTTTCCCGGCTTCCGCTTCTCCCCCACCGACGAGGAGCTCATTCAGTATTATCTCAAGAGGAAGCTGCACGGCTCCGACGACGGCGTC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131021522
ATGGGCAGCTGTAATATCAGCGACAACGACAGATCAATTTGTTCCATGGAAATCTCCATAGCCGAAGCTTCTTCCATGTTTCCCGGCTTCCGCTTCTCCCCCACCGACGAGGAGCTCATTCAGTATTATCTCAAGAGGAAGCTGCACGGCTCCGACGACGGCGTCGAAGTCATCCCTGAAGTTGATATTTGCAGACATGAACCTTGGGATTTACCAGGTCAATCAGTGATACAATCGGACAACGAGTGGTTCTTCTTCTC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057806734.1
MGSCNISDNDRSICSMEISIAEASSMFPGFRFSPTDEELIQYYLKRKLHGSDDGVEVIPEVDICRHEPWDLPGQSVIQSDNEWFFFSPRGRKYPNGSQSKRATVSGYWKATGKERSVKSGSTQIGTKRTLVFHMGRAPKGQRTEWIMHEYTTSEKSQDAMVVCRLRKNREFHLNDSVGEGAVENSAPSVSGLVDGAKTAGSCSKDCSSSHNSHSVEQLDTGSESEEKVTNESSHPVSSLNEEDDCYADIMKDDIIKLDDS...

XP_057806740.1
MGSCNISDNDRSICSMEISIAEASSMFPGFRFSPTDEELIQYYLKRKLHGSDDGVEVIPEVDICRHEPWDLPGQSVIQSDNEWFFFSPRGRKYPNGSQSKRATVSGYWKATGKERSVKSGSTQIGTKRTLVFHMGRAPKGQRTEWIMHEYTTSEKSQDAMVVCRLRKNREFHLNDSVGEGAVENSAPSVSGLVDGAKTAGSCSKDCSSSHNSHSVEQLDTGSESEEKVTNESSHPEDDCYADIMKDDIIKLDDSSLSENP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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