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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002399`

染色体: Chr04 坐标: 38539405-38544239 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002399`
名称	SmilChr04G002399
描述	uncharacterized SmilChr04G002399
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	38539405 - 38544239 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021531`
GeneID	`131021531`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021531`
原始查询	`LOC131021531`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Major facilitator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816840]; symbol=AT2G23093; hit=AT2G23093; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Major facilitator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816840]; symbol=AT2G23093; hit=AT2G23093; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G23093` (AT2G23093) Major facilitator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816840] identity=50.7; qcov=0.894; evalue=3.91e-133; confidence=high
Rice	`Os08g0113800` - identity=45.1; qcov=0.906; evalue=2.87e-110; confidence=high
GO	GO:0015098 (molybdate ion transmembrane transporter activity); GO:0015689 (molybdate ion transport); GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF05631 (MFS_5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021531

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057806743.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057806743.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057806742.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806742.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806742.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:38539695`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B83,C21,C29,C59
`Chr4:38539916`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B124,B135,B58,C37
`Chr4:38541143`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B20,C8
`Chr4:38541176`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr4:38541364`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B83,C21,C29,C59
`Chr4:38541368`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr4:38543687`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806742.1

445 aa

222

445

MFS_5

PF05631 MFS_5 20-339 aa

XP_057806743.1

426 aa

213

426

MFS_5

PF05631 MFS_5 59-320 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806742.1`	Pfam	`PF05631`	MFS_5	Family	20	339	2.4e-26	93.2	Sugar-tranasporters, 12 TM
`XP_057806743.1`	Pfam	`PF05631`	MFS_5	Family	59	320	7e-24	85.1	Sugar-tranasporters, 12 TM

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950759.1
CCATTTTTCAGTCAAGAACCTTATGCTCAATTGTGCTCGCTAATCGCTTTCAATTTGATTTGGTTCAATCGAATTCGTTCACCACGATTTTCGACTGGGTTCACCGTTTATGGTGAACTTAACAATCAACAGTCGTGAGACAATCTGTGTATCAAATGGGAGTTGTTATTGAATCTGATATCTGGGAACCAAACAGATCGATTTATGTACTATTATTCATCTGCTGCGTGGTTTCAATTTTCTGTTTGCCCGCCAAATCT...

XM_057950760.1
CATTTTTCAGTCAAGAACCTTATGCTCAATTGTGCTCGCTAATCGCTTTCAATTTGATTTGGTTCAATCGAATTCGTTCACCACGATTTTCGACTGGGTTCACCGTTTATGGTGAACTTAACAATCAACAGTCGTGAGACAATCTGTGTATCAAATGGGAGTTGTTATTGAATCTGATATCTGGGAACCAAACAGATCGATTTATGTACTATTATTCATCTGCTGCGTGGTTTCAATTTTCTGTTTGCCCGCCAAATCTA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131021531
ATGGGAGTTGTTATTGAATCTGATATCTGGGAACCAAACAGATCGATTTATGTACTATTATTCATCTGCTGCGTGGTTTCAATTTTCTGTTTGCCCGCCAAATCTAGTACAAATGTGCTCGATCACGCGTCTTCCGCTTCTCTTCTCCGTTTTCAGCGCAAATTTCTCCTCCTCTACGCTATATCCTCAGTGATGCAGGGTTTGTGGGCTGTGTTTGGAGAATACGAGTTGGCGTATTATGGATTCAGTAAAGATCAATT...

LOC131021531
ATGTACTATTATTCATCTGCTGCGTGGTTTCAATTTTCTGTTTGCCCGCCAAATCTAGTACAAATGTGCTCGATCACGCGTCTTCCGCTTCTCTTCTCCGTTTTCAGCGCAAATTTCTCCTCCTCTACGCTATATCCTCAGGGTTTGTGGGCTGTGTTTGGAGAATACGAGTTGGCGTATTATGGATTCAGTAAAGATCAATTACTGACAGTTTTTTCCGTTGGATTTGCGGTCTCTCTGTTTATCGGGAGCTTTCTGGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057806742.1
MGVVIESDIWEPNRSIYVLLFICCVVSIFCLPAKSSTNVLDHASSASLLRFQRKFLLLYAISSVMQGLWAVFGEYELAYYGFSKDQLLTVFSVGFAVSLFIGSFLGVLSDLLGHKKLCLLFFLLHLLVSLWKLVFGTSTFWLTSIFLSLASSIFSFGFEAWMVVEQDKLGQRQEVLNDMFWMMTFLESASFIGSQALANYLIDDNVIRNIKSLWIGAAVLAVLAVCLVTRGWQEAPQTAALKDYRVSFHRHVISDKRIWL...

XP_057806743.1
MYYYSSAAWFQFSVCPPNLVQMCSITRLPLLFSVFSANFSSSTLYPQGLWAVFGEYELAYYGFSKDQLLTVFSVGFAVSLFIGSFLGVLSDLLGHKKLCLLFFLLHLLVSLWKLVFGTSTFWLTSIFLSLASSIFSFGFEAWMVVEQDKLGQRQEVLNDMFWMMTFLESASFIGSQALANYLIDDNVIRNIKSLWIGAAVLAVLAVCLVTRGWQEAPQTAALKDYRVSFHRHVISDKRIWLLSWAQSCVHFSVAAFWILW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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