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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002411`

染色体: Chr04 坐标: 38730799-38732461 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002411`
名称	SmilChr04G002411
描述	LOB domain-containing protein 38-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	38730799 - 38732461 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021539`
GeneID	`131021539`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021539`
原始查询	`LOC131021539`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	LOB domain-containing protein 38-like
产物	LOB domain-containing protein 38-like
Arabidopsis	`AT3G49940` (LBD38) LOB domain-containing protein 38 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824156] identity=57.1; qcov=1.21; evalue=4.71e-80; confidence=high
Rice	`Os07g0589000` - identity=53.7; qcov=1.1; evalue=5.04e-71; confidence=high
GO	GO:0010468 (regulation of gene expression)
KEGG	-
Pfam	PF03195 (LOB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021539

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806756.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806756.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806756.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806756.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057806756.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:38731140`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B35,B44,B7,C28,C8
`Chr4:38731173`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr4:38731215`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr4:38731282`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B81,C41,C6
`Chr4:38731328`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B35,B44,B7,C28,D10
`Chr4:38731446`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B35,B44,B7,C28,C8
`Chr4:38731460`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B14,C10,C4,C57
`Chr4:38731573`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C22
`Chr4:38731573`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C22
`Chr4:38731576`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B87,C53
`Chr4:38731587`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B34,C26,C46
`Chr4:38731588`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806756.1

208 aa

104

208

LOB

PF03195 LOB 2-100 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806756.1`	Pfam	`PF03195`	LOB	Family	2	100	6.9e-24	85.0	Lateral organ boundaries (LOB) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950773.1
TAACTCATATATCTCTCCATTAATTGCGCGTCTACATATTTATAATTAAGTTTGATAACATGATTGATTTATTTATTTTTAAAAAAATACGCACAAAAAGCTGATAAGCATAGATAATTATGGGGTTTGTGATGTCAATTTATAAGGCCCACACAATTTGTCGGAAATTGATTTGTGGCCTGAGACCGTGGGATTGTACAAGTTGTTGTAGTAGCTAAGGTGTGTCGTGTGTGTACAGACTCACTGAAATGATAATTTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021539
ATGAGTTGCAATGGATGCCGCGTGCTTCGAAAAGGGTGCAGCGAAACCTGTATTCTAAGACCTTGTTTGCAGTGGATCGAGAGCACCGAGGCACAAGGCCACGCCACCGTCTTCGTCGCCAAGTTCTTCGGCCGCGCCGGCCTCATGTCCTTCATCTCCGCCGTCCCTGAAACGCAGAGGCCTGCTCTCTTTCAGTCGTTGCTGTTCGAAGCAGCCGGGAGGACCGTCAATCCGGTCAATGGGGCGGTGGGCCTTCTGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806756.1
MSCNGCRVLRKGCSETCILRPCLQWIESTEAQGHATVFVAKFFGRAGLMSFISAVPETQRPALFQSLLFEAAGRTVNPVNGAVGLLGTGNWHVCQAAVETVLRGGALKPIPELLGGESAPDDASDCTDMFRLQHHACPSSKRRRLPDEPPKVMQLADLDLSLTPGKKGGALPEKRRLGSPSMNSEGSVTTTCTGDCRANELKLLNLFN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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