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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002420`

染色体: Chr04 坐标: 38830216-38833020 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002420`
名称	SmilChr04G002420
描述	probable N-acetyltransferase HLS1
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	38830216 - 38833020 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021549`
GeneID	`131021549`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021549`
原始查询	`LOC131021549`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable N-acetyltransferase HLS1
产物	probable N-acetyltransferase HLS1
Arabidopsis	`AT2G23060` (AT2G23060) Acyl-CoA N-acyltransferases (NAT) superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816836] identity=66; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0764000` - identity=59.9; qcov=1.01; evalue=2.33e-160; confidence=high
GO	GO:0016747 (acyltransferase activity, transferring groups other than amino-acyl groups)
KEGG	-
Pfam	PF00583 (Acetyltransf_1); PF08445 (FR47)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021549

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057806767.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057806767.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057806767.1`
4	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057806767.1`
5	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057806767.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:38830716`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr4:38830720`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,C81
`Chr4:38830777`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr4:38830791`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B105,C6
`Chr4:38830816`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr4:38830855`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C39
`Chr4:38830855`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr4:38831964`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B81,C41,C6
`Chr4:38832132`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B122,C32,C68
`Chr4:38832236`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B81
`Chr4:38832236`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B81
`Chr4:38832238`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806767.1

405 aa

202

405

Acetyltransf_1

FR47

PF00583 Acetyltransf_1 73-171 aa PF08445 FR47 114-172 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806767.1`	Pfam	`PF00583`	Acetyltransf_1	Family	73	171	6.8e-14	52.8	Acetyltransferase (GNAT) family
`XP_057806767.1`	Pfam	`PF08445`	FR47	Family	114	172	6.1e-05	23.6	FR47-like protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950784.1
ACATCAACATATATAACTTTAGTAATATATGGACATATTCCTATATACCTTAATGTGATCTAATCCAACGGTGAGGTAAGATTTCATTTGATGCTCATGAAATATGCATATAGAATAATTGCACAGAGCCACAGGTTAATTTGTGTCTTCTTCTTTTTTTTCAAAATGGTTTTTTTTTCTTGAGATTGAGATTACGGAGGTCCCTCTATAAATAGGAGCAGCACTACTAATCCTTCACTACCTCTCCTCTAATCTAATCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021549
ATGTATGTGGCGGTGGTGGTGGTGCGAGAATACGATGCGAAAACAGATAGCAGAGCAGTGGAGGAAGTGGAGAATAGGTGCGAGGTGGGGCCCAGCGGAAAACTCTCTCTCTACACCCACCTCTTGGGCGACCCCGTTTGTCGAGTCCGCCATTCTCCGGCTTCTCTCATGCTGGTGGCGGAGATGACGGTGGGTGGCGGCGGAGACGATAAGGATAAGAGAGAGATAGTGGGGATGATTAGAGGTTGCATCAAAACCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806767.1
MYVAVVVVREYDAKTDSRAVEEVENRCEVGPSGKLSLYTHLLGDPVCRVRHSPASLMLVAEMTVGGGGDDKDKREIVGMIRGCIKTVTCGSKVSRNGKNCPTLPLPLPLYTKLAYILGLRVSPSHRRMGIGLKLVQKMEEWFVDNGAEYSYMATEKDNLPSLELFTGKCGYSQFRTPAILVQPVYAHRVRVSKKATIIKLSPADAEALYRRRFATTEFFPRDIDAILNNKLCLGTFLAVPVGSWSGPDGFLGGSWAVISV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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