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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002434`

染色体: Chr04 坐标: 38983845-38989085 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002434`
名称	SmilChr04G002434
描述	probable amino-acid acetyltransferase NAGS1, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	38983845 - 38989085 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021561`
GeneID	`131021561`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021561`
原始查询	`LOC131021561`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable amino-acid acetyltransferase NAGS1, chloroplastic
产物	probable amino-acid acetyltransferase NAGS1%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT2G22910` (NAGS1) N-acetyl-l-glutamate synthase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816822] identity=71.2; qcov=0.889; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0585600` - identity=68.2; qcov=0.875; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004042 (L-glutamate N-acetyltransferase activity, acting on acetyl-CoA as donor); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006526 (L-arginine biosynthetic process)
KEGG	smil00220 (Arginine biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01210 (2-Oxocarboxylic acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00583 (Acetyltransf_1); PF00696 (AA_kinase); PF13508 (Acetyltransf_7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021561

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057806796.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057806796.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806796.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806796.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806796.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:38984068`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B125,B90,B92,C87
`Chr4:38985217`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr4:38985267`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B60
`Chr4:38985267`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B60
`Chr4:38985704`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr4:38986801`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,C6
`Chr4:38988637`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr4:38988779`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr4:38988790`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806796.1

601 aa

300

601

AA_kinase

Acetyltransf_1

Acetyltransf_7

PF00696 AA_kinase 106-310 aa PF00583 Acetyltransf_1 475-547 aa PF13508 Acetyltransf_7 481-559 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806796.1`	Pfam	`PF00696`	AA_kinase	Family	106	310	5.7e-10	40.0	Amino acid kinase family
`XP_057806796.1`	Pfam	`PF00583`	Acetyltransf_1	Family	475	547	7e-12	46.4	Acetyltransferase (GNAT) family
`XP_057806796.1`	Pfam	`PF13508`	Acetyltransf_7	Domain	481	559	3.7e-11	44.0	Acetyltransferase (GNAT) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950813.1
GTTTGATTTTTAAGTAGAAATTTTTTGTGGCAAATAAAGCACACAACTTGTGACAACTATTAGATATTCTGACTTTAGTCATCATTAAATTCAAAATAAAATGGAGCACGTAAGCAAATGCTTCAAGATTCTCTGAAACCGCCGCCGCCGCCCCCTCCCGCCACCTACCTCCCATGCTCATCCACCACCTCTTCCCTTGCCACCTTTATTCCGCTCCAAAAATTAGGGTTTTATCTGCGTAACAAATTCTTGTCGACTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021561
ATGGCTGCTGCTTCTCCGAGCCCTTGCCCACCAATCCTCAACCACCACAACCGAACACGCAGACCATCTTTTCATCGTAGCTCAATTTGGAGCTCGAATGTTATGAAAAATCAGTTAATCAGCAAGTTTCGCGGAGTACAATCGGCAAAAGCTTCGCCTTTGGAGGATAAACTTGATGTGAATGGGGAGACTGGAAGCGCTGGAATCGAAGCGAGCTGTGCAGTTAAGGATGAGCTGTTCGTGCGCTTCTTCCGCGAGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806796.1
MAAASPSPCPPILNHHNRTRRPSFHRSSIWSSNVMKNQLISKFRGVQSAKASPLEDKLDVNGETGSAGIEASCAVKDELFVRFFREAWPYFQAHRGSTFVVLISAEIVDSPHLDPILMDISLLHGLGIKFVLVPGTHVQIDRLLAERGCDPKYFGSYRITDSDSLDAAMNAAGRIRIMIEAKLSPGPSLSGIRRHGDNSRLHDGVSVASGNFLAAKRRGVVEGIDYGSTGEVKKVDVSRIRERLDQDSIVLLSNLGYSSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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