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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002437`

染色体: Chr04 坐标: 39035854-39040148 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002437`
名称	SmilChr04G002437
描述	uncharacterized SmilChr04G002437
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	39035854 - 39040148 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021563`
GeneID	`131021563`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021563`
原始查询	`LOC131021563`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DUF4228 domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836898]; symbol=AT5G67620; hit=AT5G67620; species=arabidopsis; confidence=high
产物	DUF4228 domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836898]; symbol=AT5G67620; hit=AT5G67620; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G67620` (AT5G67620) DUF4228 domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836898] identity=55.2; qcov=1.08; evalue=4.31e-59; confidence=high
Rice	`Os03g0200200` - identity=41.6; qcov=1.27; evalue=2.03e-39; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14009 (PADRE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021563

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057806797.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057806797.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057806797.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806797.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806797.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:39036031`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B69,C59,C84
`Chr4:39036033`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr4:39036070`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B128
`Chr4:39036080`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,C81
`Chr4:39036100`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B1
`Chr4:39036100`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B1
`Chr4:39036104`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr4:39036105`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B1
`Chr4:39036105`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B1
`Chr4:39036112`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,B7
`Chr4:39036120`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr4:39036126`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B121,B81,B83,C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806797.1

168 aa

168

PADRE

PF14009 PADRE 1-165 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806797.1`	Pfam	`PF14009`	PADRE	Domain	1	165	5e-29	102.7	PADRE domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950814.1
TTGTGGATGAGATGGAATTGAATATTCATGTCATCCCCAAGCGGGGGCCTCACACTCTCTCTCTCTCATATTTTAGTCCCACCTGCAAACGCAAAGTCATAAACCAGAACCTGCCATTTTCAGGTGGTTTGGCAGATCTATCTAACACTCCACGTCTCCTCTCCTCCTTTAATGTTTCACTTAATCCCCATCATCACCATTATTCTATTTTATTTTTCGTTTACATTTCGCTTTCTTCACACGCTTGCCACCCTCCATTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021563
ATGGGGAATTGCCAGGCGGCGGAGGCGGCGACGGTGGTGATACAGCACCCCAGCGGTGGCAAGGTGGACAGGATTTACTGGTCGGTGAGCGCTAGCGAGATCATGAATGCCAATCCCAGTCACTACGTCGCACAGGTGGTGGCCACGGGGGCCGTGGCGGCGGAAAACGGTGCTCCAATCAAGCAGCTAAAGCTTCTCCGCCCCGACGACACTCTCGTCATTGGACAAGTTTACCGTCTCGTCAGCTTTGAAGATGTGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806797.1
MGNCQAAEAATVVIQHPSGGKVDRIYWSVSASEIMNANPSHYVAQVVATGAVAAENGAPIKQLKLLRPDDTLVIGQVYRLVSFEDVLKEFAAKKCVKLGKLLKERGPFDLQRKRNSNRQSACVKTEVNHDSSGSVSGSGSSRGGVGRVHSSGGGQWRPALQSISELGS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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