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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002450`

染色体: Chr04 坐标: 39225458-39228680 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002450`
名称	SmilChr04G002450
描述	psbP domain-containing protein 1, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	39225458 - 39228680 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021578`
GeneID	`131021578`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021578`
原始查询	`LOC131021578`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	psbP domain-containing protein 1, chloroplastic
产物	psbP domain-containing protein 1%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G15510` (PPD1) Photosystem II reaction center PsbP family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827223] identity=74.5; qcov=0.99; evalue=1.59e-107; confidence=high
Rice	`Os07g0275100` - identity=79.2; qcov=0.864; evalue=4.88e-99; confidence=high
GO	GO:0005509 (calcium ion binding); GO:0009523 (photosystem II); GO:0009654 (photosystem II oxygen evolving complex); GO:0015979 (photosynthesis); GO:0019898 (extrinsic component of membrane)
KEGG	-
Pfam	PF01789 (PsbP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021578

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057806817.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057806817.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	1.00000	`XP_057806821.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806817.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806817.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:39226113`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr4:39227741`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr4:39227982`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B75,B95,D6
`Chr4:39228074`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr4:39228425`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806817.1

271 aa

136

271

PsbP

PF01789 PsbP 91-266 aa

XP_057806818.1

271 aa

136

271

PsbP

PF01789 PsbP 91-266 aa

XP_057806819.1

269 aa

134

269

PsbP

PF01789 PsbP 89-264 aa

XP_057806820.1

269 aa

134

269

PsbP

PF01789 PsbP 89-264 aa

XP_057806821.1

206 aa

103

206

PsbP

PF01789 PsbP 26-201 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806817.1`	Pfam	`PF01789`	PsbP	Domain	91	266	1.9e-38	132.6	PsbP
`XP_057806818.1`	Pfam	`PF01789`	PsbP	Domain	91	266	1.9e-38	132.6	PsbP
`XP_057806819.1`	Pfam	`PF01789`	PsbP	Domain	89	264	2e-38	132.6	PsbP
`XP_057806820.1`	Pfam	`PF01789`	PsbP	Domain	89	264	2e-38	132.6	PsbP
`XP_057806821.1`	Pfam	`PF01789`	PsbP	Domain	26	201	8.8e-39	133.7	PsbP

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950835.1
AAAATTTATAGACAGCCAAGTAAGGCCCAATCCTCTTGTTCTTCTTTTCTCCCTCATCATCTACTACTGTCTGCAACCTCTCCTTCTCTTTCTTTTTTCATTCCTGCCATCTTCTAATTCTTCTTCTCAAACACTTCCTCTTCGACCACCGCCGAATCTCATGAGTCTTCAAATGATCGTATCTTCAGTGGCTCCGCCGGCTGCTGTCGGTTCTGGAAGTGCGTCGTATAAAGAGAGGTTTGCCGCCGGAGGCCTCACTT...

XM_057950836.1
AATTTATAGACAGCCAAGTAAGGCCCAATCCTCTTGTTCTTCTTTTCTCCCTCATCATCTACTACTGTCTGCAACCTCTCCTTCTCTTTCTTTTTTCATTCCTGCCATCTTCTAATTCTTCTTCTCAAACACTTCCTCTTCGACCACCGCCGAATCTCATGAGTCTTCAAATGATCGTATCTTCAGTGGCTCCGCCGGCTGCTGTCGGTTCTGGAAGTGCGTCGTATAAAGAGAGGTTTGCCGCCGGAGGCCTCACTTCA...

CDS

5 records

下载 CDS FASTA

LOC131021578
ATGAGTCTTCAAATGATCGTATCTTCAGTGGCTCCGCCGGCTGCTGTCGGTTCTGGAAGTGCGTCGTATAAAGAGAGGTTTGCCGCCGGAGGCCTCACTTCAGCTTCCAAAGAGCTCTCTTCTTTGCCCTCCACCTTTTTTCCCCTCCAAAAGACACAGACTAGTAAAGATTTTGCAGTTCCAAGGCGGAAAGCAATGGCATTGATTCTATCAGGTTTCATCTATTCTCAAGCTGGCACGTGCGATAATGCTTTTGCACA...

Protein

5 records

下载 Protein FASTA

XP_057806817.1
MSLQMIVSSVAPPAAVGSGSASYKERFAAGGLTSASKELSSLPSTFFPLQKTQTSKDFAVPRRKAMALILSGFIYSQAGTCDNAFAQSIAFREYIDQFDGYTLKYPPNWIQVRGAGADIFFRDPFVLDENISVNISSPSSSKYKSVKDLGSPEEAGKKVLRQYLTEFMSTRLGVRRESRILSTSSKVASDGRLYYEVEVNIKSYANNNELAVMPEDRVARLEWDRRYLSVLGVENNRLYELRLQTPEKSFVEEENELREI...

XP_057806818.1
MSLQMIVSSVAPPAAVGSGSASYKERFAAGGLTSASKELSSLPSTFFPLQKTQTSKDFAVPRRKAMALILSGFIYSQAGTCDNAFAQSIAFREYIDQFDGYTLKYPPNWIQVRGAGADIFFRDPFVLDENISVNISSPSSSKYKSVKDLGSPEEAGKKVLRQYLTEFMSTRLGVRRESRILSTSSKVASDGRLYYEVEVNIKSYANNNELAVMPEDRVARLEWDRRYLSVLGVENNRLYELRLQTPEKSFVEEENELREI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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