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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G002454`

染色体: Chr04 坐标: 39278556-39280745 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G002454`
名称	SmilChr04G002454
描述	1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase 3-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	39278556 - 39280745 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021582`
GeneID	`131021582`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021582`
原始查询	`LOC131021582`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase 3-like
产物	1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase 3-like
Arabidopsis	`AT4G37770` (ACS8) 1-amino-cyclopropane-1-carboxylate synthase 8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829933] identity=71.6; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0727600` (ACS1) 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase 1-like [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:4333976] identity=68.1; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006520 (amino acid metabolic process); GO:0008483 (transaminase activity); GO:0009058 (biosynthetic process); GO:0030170 (pyridoxal phosphate binding)
KEGG	smil00270 (Cysteine and methionine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00155 (Aminotran_1_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021582

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057806824.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057806824.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057806824.1`
4	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057806824.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806824.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:39278696`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B110,B114,B28,C56
`Chr4:39279242`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,C2
`Chr4:39279253`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B109,C55,C77,D10
`Chr4:39279667`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr4:39279926`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C67
`Chr4:39279926`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C67
`Chr4:39279970`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr4:39279986`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C79
`Chr4:39279986`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C79
`Chr4:39280072`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B110,B128,B28,C56
`Chr4:39280075`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr4:39280154`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806824.1

460 aa

230

460

Aminotran_1_2

PF00155 Aminotran_1_2 40-420 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806824.1`	Pfam	`PF00155`	Aminotran_1_2	Domain	40	420	3.9e-103	346.1	Aminotransferase class I and II

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950841.1
AATATACTTCAACAATCTCGCTCTCTCTCTCTACAGTCGCAATTTTTTCTATTTTAGTCGATACAAGTTTTGATCAAAGAGAAATGAGGATGTCGAAGAAAGCTGCATGCAACTCCCACGGCCAAGATTCTTCCTACTTCCTTGGATGGCAGGAATACGAGAAGAATCCCTACCATCAGATTACCAATCCCAATGGGATCATTCAAATGGGCCTAGCAGAGAATCAACTCTCGTTCGATCTACTGGAATCGTGGCTGGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021582
ATGAGGATGTCGAAGAAAGCTGCATGCAACTCCCACGGCCAAGATTCTTCCTACTTCCTTGGATGGCAGGAATACGAGAAGAATCCCTACCATCAGATTACCAATCCCAATGGGATCATTCAAATGGGCCTAGCAGAGAATCAACTCTCGTTCGATCTACTGGAATCGTGGCTGGCCGCAAATCCTGATGCAGCCGCCTTCAAGAGAGGCGGTCACTCCATTTTCAGAGAGCTAGCGCTCTTCCAAGACTATCACGGCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806824.1
MRMSKKAACNSHGQDSSYFLGWQEYEKNPYHQITNPNGIIQMGLAENQLSFDLLESWLAANPDAAAFKRGGHSIFRELALFQDYHGLPAFKNALVQFMTEIRGNKVRFDPNNIVLTAGATSANETLIFCLADPADAFLLPTPYYPGFDRDLKWRTGVEIVPIHCTSRNGFRITSSALQDAYQLAQNRNLKVKGVLLTNPSNPLGITLNRNELNLLLNFVDAKGIHLISDEIYSGTVFDSTEFISIMELLPNRNSELSNRV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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